生物物理学重点考研笔记.pdf
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1、生物物理学重点复习笔记 第一章 生物大分子:蛋白质、核酸、多糖和脂质。生物大分子特定的生物学功能取决于其特定的空间构象。 蛋白质的意义:是生命活动的物质基础,是细胞和生物体的主要组成成分。 蛋白质的化学组成:构成元素:碳 C,氢 H,氧 O,氮 N,硫 S等。 N的含量一般较恒定:平均为 16%,每克样品中含氮克数 6.25 100即为 100克样品中蛋白质含量 等电点 :将氨基酸水溶液的酸碱度加以适当调节,使羧基与氨基的电离程度相等,即氨基酸所带正、负电荷数目正好相等,此时溶液的 pH称为该氨基酸的等电点,用 pI表示。 中性溶剂 中,羟基的电离程度略大于氨基,溶液呈微弱酸性 蛋白质: 在水
2、溶液中形成的颗粒具有胶体溶液的特征 (布朗运动、丁道尔现象、不能透过半透膜、吸附能力等 )。 按形状分类:球状蛋白质、纤维蛋白质 按化学结构分:简单蛋白质、结合蛋白质 根据溶解度分类:可溶蛋白质、醇溶性蛋白质、不溶性蛋白质 蛋白质的一级结构: 由共价键结合在一起的氨基酸残基的排列序列。一级结构是蛋 白质功能的基础 蛋白质的二级结构: 指多肽链向单一方向卷曲而形成的有周期性重复的主体。 -螺旋、 -片层 、无规卷曲、回折 。作用力:以肽链内或各肽间的氢键。 螺旋:肽链骨架形成每周 3.6个氨基酸的右手螺旋上升 0.54nm,每个残基旋转 100度。 蛋白质的三级结构: 是线状、螺旋片状结构的进一
3、步卷曲和折叠,形成球形或椭圆形的结构,它是蛋白质分子在二级结构的基础上进一步卷曲折叠,构成一个很不规则的具有特定构象的蛋白质分子。螺旋、折叠、卷曲及无规卷曲等二级结构的多肽链在三维空间的排列方式。作用力:疏水作用(主要)、氢键、离子键、偶极与偶极间的相互作用、二硫键。若蛋白质分子仅有一条多肽链组成,三级结构就是它的最高结构层次。 蛋白质的四级结构: 具有三级结构的蛋白质亚单位通过非共价键缔合的结果。亚基之间 (维持蛋白质四级结构 )的结合力主要是疏水作用,其次是氢键和离子键。 氨基酸链接的基本方式:肽键 CO NH 结构域: 是蛋白质构象中二级结构与三级结构之间的一个层次 蛋白质特定的构象和功
4、能是由其 一级结构 所决定的。 蛋白质的变性: 天然构象一旦发生变化,必然会影响到它的活性。如发生破坏性的变化,蛋白质的生物活性就会丧失。 使蛋白质变性的物理因素:加热、紫外线、高压等;使蛋白质变性的化学因素:有机溶剂、脲、胍等 变性后性质的变化 :生物活性降低、溶解度降低、易被蛋白酶水解 变性的实质 :蛋白质的空间构象被破坏,一级结构保存完好。 蛋白质的复性 :当去除变性因素时,变性蛋白质又恢复原来的 三维结构。 别构效应 :当某种小分子物质特异地与某种蛋白质(或酶)结合后(结合部位多在远离活性部位的另一部位,通常称为别位),能够引起该蛋白质(或酶)的构象发生微妙而有规律的变化,从而使其活性
5、发生变化。 别构效应剂: 具有这种特性的蛋白质或酶称为别构蛋白质或别构酶,引起这种效应的小分子物质称为别构效应剂。 别构效应取决于 亚基 的相互作用。亚基之间的信息传递是通过蛋白质构象的变化实现的。 核酸 分为 脱氧核糖核酸 (DNA)和核糖核酸 (RNA)。 DNA存在于 :细胞核内染色质中、线粒体和叶绿体中。是遗传信息的携带者。 RNA在细胞核内产生,后进入细胞质,在蛋白质合成中起主要作用。 核酸的组成元素: C、 H、 O、 N、 P等 特点 : 1.核酸一般不含 S元素; 2.P元素的含量比较固定为 9%10% 核酸定量测定方法:测定 P含量代表核酸量 核苷酸 是核酸的基本组成单位 组
6、成核酸的基本单元包括 磷酸、戊糖、碱基 。 A与 T之间形成 2个氢键, G和 C之间形成 3个氢键。 DNA: AGCT RNA: AGCU 核苷酸中的戊糖有两种:核糖和脱氧核糖 核苷中的戊糖上羟基与磷酸以磷酸酯键连接成核苷酸 核酸分子由核苷酸单体通过 3, 5 -磷酸二脂键 聚合成多核苷酸长链,核苷酸单体之间通过 脱水缩合 而成聚合物。 核酸的一级结构 :许多核苷酸缩合成核苷酸链,各核苷酸的残基沿多核苷酸链排列的顺利。 DNA的一级结构 :四种核苷酸按照一定的排列顺序,通过磷酸二酯键链接形成的多核苷酸,因核苷酸间的差异仅仅是碱基不同 (故又叫碱基顺序 )。 DNA中不同排列顺序的 DNA区
7、段构成特定的功能单元,基因。 DNA是右螺旋的双螺旋结构,在生理状态下很稳定,维持这种稳定性的主要因素是碱基堆积力。 碱基堆积力 :指在 DNA双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠于双螺旋的内侧,相邻疏水 性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。 DNA的二级结构 :双螺旋结构 DNA分子中其它的弱键在维持双螺旋结构的稳定也起一定的作用。这些 弱键 包括:互补碱基对之间的氢键、磷酸基团上的负电荷与介质中的阳离子之间形成的离子键、范德华引力。 氢键维持双链 横向 稳定性,碱基堆积力维持双链 纵向 稳定性。 相邻碱基平面距离 0.34nm,每 10 个碱基上升一个螺旋, 34nm,
8、螺旋直径 2nm。 DNA结构的特性 :多样性、特异性、稳定性 DNA的特异性 :表现在四种脱氧核苷酸的比例 (即数目 )和碱基对的排列顺序不同。 DNA分 子的 稳定性 :由氢键的多少决定的 DNA的三级结构 :线状 DNA形成扭结、超螺旋和多重螺旋以及环状 DNA形成的扭结、超螺旋和连环等个多种类型。 RNA的一级结构 :四种核苷酸以 3, 5 -磷酸二脂键链接而成 稳定因素 :氢键和碱基堆积力 RNA的二级结构 : 茎环结构 :双链结构是由 RNA单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,通过氢键结合形成反平行右手双螺旋结构 (称为茎 ),不能配对的区域形成突环 (称为环 ),被排斥在双
9、螺旋结构之外。 RNA的三级结构 : RNA分子进一步扭曲折叠形成更复杂的三级结构。 RNA的三种类型 : rRNA(核糖体 RNA)、 mRNA(信使 RNA)、 tRNA(转运 RNA) tRNA的一级结构: tRNA分子中核苷酸的排列顺序。 tRNA的二级结构: tRNA分子呈三叶草形 。 tRNA的三级级结构: 倒写的 L字母 。 电泳 :用中性或偏碱性的缓冲液核酸解离成阴离子,置于电场中向阳极移动 核酸为两性电解质 核酸变性 :核酸双螺旋的解链,变成单链的过程。即核酸的双螺旋区的氢键断裂、变成单链的无规则线团,使核酸的某些性质发生改变,部分或全部生物活性丧失。 增色效应 :指变性后
10、DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应。 由温度升高引起的变性称 热变性 。 生物大分子化学组成和特定结构构成了其生物功能多样性的基础。 自然界中的 四种相互作用 :引力相互作用、电磁相互作用、强相互作用、弱相互作用。 生物大分子一级结构由强相互作用决定,高级结构由弱相互作用决定。 区分强弱的标准 是热运动瓦解相互作用的能量 分子间的弱相互作用包括氢键、范德华力、疏水作用等。 其物理本质: 永久偶极矩、瞬时偶极矩、诱导偶极矩三者之间的相互作用。 等量正负电荷相距很近所组成的系统 偶极子 广义范德华力包括 3种弱作用力,即定向效应、诱导效应、分散效应 疏水作用最直 观的表现 :类脂等两亲性分子在水中
11、形成稳态胶束以及蛋白质在水中的折叠。 盐键的稳定性影响因素 :升高温度时盐键的稳定性增加;加入非极性溶剂而加强;加入盐类而减弱。 第二章 生物膜 是对细胞膜及细胞内膜系统(包括内质网,高尔基体,溶酶体,线粒体,叶绿体等)的统称,又称质膜,是一层厚约 5-10nm的膜,围绕在细胞最外层。 细胞膜 结构 3层:内外两层电子致密带,中间透明带 生物膜结构 :主要由脂质、蛋白质和糖类等物质组成。 Singer和 Nicholson于 1972 年提出细胞膜的流动镶嵌模型: 膜的共同结构特点是以液的脂质 双分子层为基架,其中镶嵌着具有不同分子结构、而具有不同生理功能的蛋白质。 膜脂 (磷脂 50%以上
12、糖脂 5% 固醇 1/3)是生物膜基本组成成分 细胞膜脂双层的脂类主要包括磷脂、糖脂和固醇。 磷脂: (1)是一种兼性分子,头端具有极性,是亲水的,尾部脂肪酸链为非极性,是疏水的。 (2)约占整个膜脂总量 50%以上,是构成膜脂的基本成分。 磷脂分子的分类 :甘油磷脂和神经鞘磷脂。 (3)甘油磷脂以甘油为骨架;神经鞘磷脂以鞘氨醇为骨架。 糖脂 :是一种兼性分子,普遍存在于原核和真核细胞的细胞膜中。其含量约占膜脂总量的 5%,在神经细胞膜上的含量较高约占 5%10%。 固醇: (1)固醇类也属兼性分子,含量一般不超过膜脂的 1/3 (2) 胆固醇主要存在于高等动物的细胞膜上;大肠杆菌质膜的脂双分
13、子层主要只含一种磷脂。 膜蛋白从功能上分: 运输蛋白、膜受体蛋白。 膜蛋白从分离的难易及其在膜脂双分子层上的定位分为: 膜周边蛋白、膜内在蛋白。 膜糖类 :细胞膜所含糖类甚少,糖类大多与膜蛋白结合,膜糖类的多样性或非均一性,是造成膜不对称性的重要原因之一。 膜的不对称性 : 膜的主要成分是蛋白、脂和糖,膜的不对称性主要是指这些成分分布的不对称以及这些分子在 方向 上的不对称。 膜不对称性的意义 :膜脂、膜蛋白及膜糖分布的不对称性导致了膜功能的不对称性和方向性。保证了生命活动的高度有序性。细胞间的识别、运动、物质运输、信号传递等都具有方向性。这种不对称性决定了生物膜内外表面功能的特异性。 生物膜
14、的结构模型 :脂质双分子层模型,蛋白质 -脂质 -蛋白质,单位膜模型,流动镶嵌模型。 流动镶嵌模型 :突出了膜的流动性和不对称性 膜脂的流动性:膜脂分子的运动,脂质的流动性主要指侧向运动,由脂分子本身的 性质决定。是细胞完成多种生理功能所必须的。 脂质分子流动性的影响因素: 脂肪酸链的长短:脂肪酸越短,膜的流动性越小。 温度: 生理状态下多呈液晶态;温度降低某一点时由液晶态变为晶态;温度升高到某一点时晶态又会变为液晶态;这一 临界温度 值称为相变温度。 膜脂的状态改变称为相变。 膜脂分子的运动 :侧向扩散旋转运动摆动运动伸缩震荡翻转运动旋转异构 膜蛋白的运动方式: 侧向扩散和旋转扩散 膜流动性
15、的生理意义: 细胞质膜适宜的流动性是生物膜正常功能的必要条件。 膜的流动性大有利于酶分子侧向扩散和旋转运动, 使酶活性增加。 如果没有膜的流动性,细胞外的营养物质无法进入,细胞内合成的胞外物质及细胞废物也不能运到细胞外,这样细胞就要停止新陈代谢而死亡。 膜流动性与信息传递有着极大的关系。 如果没有流动性,能量转换是不可能的。 膜的流动性与发育和衰老过程都有相当大的关系 生物膜的功能 : 1.区间 2.物质的跨膜运输 3.信号传递 4.能量传递 5.细胞间的相互作用 6.生化活性的定位 脂质体:是根据磷脂分子可在水相中自发组装成稳定的脂双层膜而制备的人工膜。 第三章 电流密度 :单位时间通过单位
16、面积的电荷 电荷密度: 功率密度: 设膜的双分子层厚度为 d,则 Rm膜的横向电阻或单位面积 膜电阻 对面积为 S(cm2)的细胞膜,其内外实际 输入电阻 为 等效电容为 Cm为 : 膜的介电常数 到达电化学平衡时,此扩散该离子的平衡电位 静息时的膜电位 : 根据氨基酸在水中的状态可分为三种类型: 酸性,氨基酸侧链在水中解离为羧基-COO-碱性,在水中解离为氨基 NH3+极性 (中性 ),氨基在水中不解离成离子基团,而是极性基团 -OH、 -NH、 -SH等由于氨基酸以极性离子 (两性离子 )形式存在,故氨基酸的中性溶液具有高介电常数。 水在 生物体中的作用: 提供细胞的生活环境影响和决定生物
17、大分子的构象和功能影响和决定生物生命活动中的物质运输、能量传递和信息传递 生物水的电特性: 很强的偶极性;能与其他水分子、离子或生物大分子的极性基团形成氢键 结构水: 水分子也可与其他离子或生物大分子之间以氢键相联系形成某种结构。 水合作用: 在离子盐溶液中,离子和水分子的偶极矩相互作用,使离子临近的水分子发生重新取向,水分子的再取向作用称为水合作用。 处于离子周围的水表现为三种状态: 最内层 (极化区 )、中间层区、远外层区 各类电介质电极化的基本过程: 原子核外电子云的 畸变极化 (快 )、分子中正、负离子的位移极化 (中 )、分子固有电矩的转向极化 (慢 ) 三个主要的色散区: 低频:色
18、散,与细胞膜的松弛行为有关,由细胞膜中或周围的电荷位移极化引起。中频:色散,细胞膜的电容所致,还与膜电荷、细胞壁材料中的偶极子松弛、贯穿壁的电导及细胞外介质中的电导有关。高频 :色散 ,组织中的水分子的偶极转动造成。 电压钳技术: 是通过插入细胞内的一根微电极向胞内补充电流,补充的电流量正好等于跨膜流出的反向离子流,这样即使膜通透性发生改变时,也能控制膜电位数值在某一固定水平。 基本思想 :用负反馈的电子线路将膜电位固定在希望的标定值上,同时测量膜电流的变化。再以电压与电流之比求出膜电导的变化,用离子通道电导特性的变化描述生物膜电导的变化。 常用的电压钳位方法有三种: 1)空间钳位:具有空间间
19、隙 2)吸附电极小细胞 3)双微电极大细胞 膜片钳技术: 用尖端直径 0.51 m的玻璃微电极吸附细胞膜表面,通过负压使电极尖开口处相接的细胞膜小片区域与细胞膜周围在电学上绝缘再此基础上固定膜电位,然后对电极尖端下仅为几 m2 的细胞膜片上的一个或几个离子通道的电流,用一个极为敏感的电流监视器 (膜片钳放大器 )测量 此电流强度 单一离子通道电流。 膜片钳的记录方式及基本操作: 细胞吸附式、全细胞记录方式、外膜向外式、内膜向外式 细胞膜电位取决于两个因素 :膜的选择通透性和膜内外的离子浓度差。 极化电位: 静息电位在细胞和组织中发生的相对于空间和时间快速变化的电位。 兴奋: 生物组织可以对外界
20、刺激发生反应,当刺激达到一定阈值时,生物组织发生反应。 动作电位 4个时相: 去极化、反极化、复极化、超极化。 动作电位: 可兴奋细胞受到刺激时在静息电位的基础上产生的可扩布的电位变化过程 静息电位: 是指细胞未受刺激时,存在于细胞膜内外两侧的外正内负的电位差 第四章 电离 :原子由于失去电子或获得电子而成为离子的过程。 电离辐射 (辐射 ):能够通过初级过程或次级过程引起电离事件的带电粒子或不带电粒子 分类 :直接电离辐射 (带电粒子导致 )、间接电离辐射 (中性粒子导致 ) 放射性活度 :放射性核素在单位时间内发生衰变的数目即衰变率。 照射量 X定义: 单位质量的空气体积中, X或光子释放
21、的所有电子在空气中全部被阻止时,产生的同一种符号的所有离子电荷的总和。 物理意义 :表示 X或射线在空气中产生电离能力大小的物理量,用 E表示 。 吸收剂量 D定义 :授予单位质量的任何电离辐射的平均能量。 意义 :在任何介质中吸收各类电离辐射能量大小的物理量。 剂量当量 H意义 :描述各类辐射相对于同一生物效应的差别。 定义 :组织中一点的吸收剂量 D 与品质因子 Q 的乘积,即加权吸收剂量。 传能线密度 LET意义 :描述射线与物质相互作用能力大小的物理量。 定义 :特定能量的带电粒子在介质中穿行单位长度路径时,由于能量转移小于某一特定值的历次碰撞数所造成的能量损失。 粒子与物质作用的形式
22、 :电离,激发,核反应。 特点: 电离能力强,穿透能力较弱,在云室中留下粗而短的径迹。 粒子形式 :电离,激发,散射,次级辐射。 特点: 电离作用较弱,穿透本领较强,云室中的径迹细而长。 中子特点:观测不到中子径迹。 射线特点:电离作用最弱,穿透本领最强,云室中不留痕迹。 躯体效应: 是指受照射的个体本身诱发的各种效应 (包括骨髓造血障碍、白内障、癌症等 )。是生物体的体细胞受到照射后产生的后果,不具遗传性。 遗传效应: 受照个体的子代个体中出现的辐射生物学效应。是生物体的生殖细胞受到照射而产生的后果。 特点 :后代身上;效应间隔时间长;影响可能极大。 随机性效应 :电离辐射的随机能量沉积。由
23、单个细胞的变异 导致的生物学效应。 确定性效应 :某器官或部分组织的相当数量的细胞被射线杀死,相应功能受到影响并可观测到形态变化或症状。 相对生物效能 (RBE): 通过将一种辐射与另一种辐射(参考辐射或基准辐射)相比较的办法来表征辐射的品质。 辐射损伤方式 :内照射、外照射和混合照射 外照射防护 :时间防护、距离防护、屏蔽防护 重离子: 原子序数等于或大于 2的原子核被 剥离或部分剥离外周电子后带正电荷的原子核。 第五章 树突: 多数神经元有多个树突,每个树突都短而分支多。分支表面有大量的细胞刺状突起,称为棘突或棘刺。 棘突: 其它神经元的终末支和树突形成突触的接触点。 轴突: 每个神经元只
24、有一个轴突。轴突从细胞体发出时的圆锥状隆起部分称为轴丘 。 轴突形态特点: 胞浆内没有尼氏体。 神经元的机能分类 :感觉神经元、运动神经元、中间神经元 。 按突触的接触部位分为三类 : 1轴突与细胞体相接触 2轴突与树突相接触 3轴突与轴突相接触 。 一个神经元的轴突末梢经多次分支,最后每一小支的末端膨大呈杯状或球状,叫做 突触小体 。这些突触小体可以与多个神经元的细胞体或树突相接触,形成 突触 。 突触由 突触前膜、突触间隙和突触后膜 构成。 突触传递功能根据传导信号的神经递质分为: 化学突触 和 电突触 细胞兴奋冲动进入脊髓后约 0.5ms,细胞体突触后膜即发生去极化,并以电紧张形式扩布到
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