SN T 1486-2004 输入性蚊类携带的黄热病毒检测方法.pdf
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1、中华人民共和国出入境检验检疫行业标准SN/T 1486-2004 输入性蚊类携带的黄热病毒检测方法Detecting methods for yellow fever virus in imported mosquitoes 2004-11斗7发布2005-04-01实施中华人民共和国发布国家质量监督检验检瘦总局SN/T 1486-2004 前言本标准的附录A为资料性附录。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口。本标准由中华人民共和国宁波出入境检验检疫局、中华人民共和国海南出入境检验检疫局、中华人民共和国陕西出入境检验检疫局负责起草。本标准主要起草人:张升、郑剑宁、俞雪钧、黄兴琪、黄廷学
2、、闰护森。本标准系首次发布的出入境检验检疫行业标准。I SN/T 1486-2004 输入性蚊类携带的黄热病毒检测方法1 范围本标准规定了国境口岸输入性蚊类中携带的黄热病毒检测的检测对象、生物安全要求、检测方法、结果的报告及处置。本标准适用于检验检疫机构对输入性蚊类体内携带黄热病毒的检测和报告。口岸发现的蚊类携带黄热病毒检测可参考本标准执行。2 规范性引用文件下列文件中的条款通过本标准的引用而成为本标准的条款。凡是注日期的引用文件,其随后所有的修改单(不包括勘误的内容)或修订版均不适用于本标准,然而,鼓励根据本标准达成协议的各方研究是否可使用这些文件的最新版本。凡是不注日期的引用文件,其最新版
3、本造用于本标准。SN/T 1243 国境口岸黄热病检验规程WS 233 微生物生物医学实验室生物安全通用准则3 术语和定义下列术语和定义适用于本标准。3. 1 输入性蚊类imported mquit侃S通过入境交通工具、集装箱、货物、行李及邮包携带入境的伊蚊属。3.2 黄热病毒yellow fever virus 为黄热病的病原体,属虫媒病毒中披膜病毒科黄病毒属。黄热病毒颗粒呈球形,直径22m38m,外有脂蛋白包膜包绕,包膜表面有刺突,病毒基因组为单股正链RNA。4 检测对象输入性蚊类中伊蚊属,主要为埃及伊蚊。5 实验室生物安全要求实验室生物安全要求见SN/T1243及WS233。下列操作必须
4、在生物安全3级(BSL-3)实验室进行:一一用蚊胸腔接种的方法分离病毒;一一一收集或浓缩病毒或其培养产物;一一溶解、固定或其他方法处理灭活的病毒;一一-可能产生含病毒气溶胶的样品处理;一一离心管和离心机转头的封闭和开启。SN/T 1486-2004 6 逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)6. 1 器材与试剂6. 1. 1 器材PCR扩增仪及PCR管、电泳仪及电泳槽、微量移液器及吸头、紫外观测灯、恒温培养箱、普通冰箱、低温冰箱(-80.C)、组织研磨器、电动匀浆器、台式高速离心机(10000 r/min)和离心管、旋涡混合器、倒置显微镜、剪刀、慑子、台式高速离心机和离心管。6.1.2 常用试剂
5、6. 1.2. 1 实验用水用于PCR(包括核酸抽提)所用的水应不含RNA酶。6. 1. 2. 2 BA斗稀释液Hanks液内含50mmol/L Tris (pH7. 6) , BSA , O. 35g/L碳酸氢铀,链霉素100g/mL,二性霉素1g/mL。6. 1. 2. 3 日qDNA聚合酶20.C保存,不要反复冻融或温度剧烈变化c6. 1. 2. 4 TE辑冲液10 mmol/L , pH8. 0 Tris-HCl,加入1mmol!L EDT A。6.1.2.5 RNA抑制荆(RN副in)一20.C保存,不要反复冻融或温度剧烈变化。6. 1. 2. 6 dNTP 含dCTP、dGTP、d
6、ATP、dTTP各10mmol/L。6. 1.2.7 裂解液4 mol/L异硫氨酸脏,25mmol/L拘梅酸铀,pH7.0 , 0. 5%Sarkosyl及100mmol/L -琉基乙醇。6.1.2.8 TBE电泳缓冲液(5X浓缩液)Tris 54.0 g,棚酸27.5g , EDTA 2.9 g,加水溶解至1000 mL,用5mol/L盐酸调节至pH8.O. 6.1.2.9 PCR反应缓冲液终浓度为50mmol!L Tris-Cl,室温pH8.3 , 40 mmol!L , 6 mmol!L氯化馍,1mmol/L DTT, 0.1 mg/mL BSA或明胶队6. 1. 2.10 其他酣町三氯
7、甲烧混合液,异丙醇,澳化乙链,琼脂糖等。6. 1. 2. 11 引物引物可以直接使用试剂盒,按说明书进行操作,也可根据要求选择其中一对引物,其序列分别如下:a) 引物对1如下:上游引物VD8: 5 -GGG TCTCCTCT AACCTCT AG-3 ; 一一一下游引物NS5YF:5-ATGCAGGACAAGACAATGGT-3 b) 引物对2如下:一一一上游引物Vg228F : 5 -G AACACACAA TCGG AACAGCTG-3勺一一一下游引物Df229R:5人ATTCCGGCAGACGCACACCTT-3。6.2 操作方法6.2.1 样晶制备SN/T 1486-2004 6. 2
8、. 1. 1 样晶采集将采集的蚊虫样本用10%葡萄糖水喂养2d以上,待胃内血液全部消化后将其冷冻致死。分类、分雌雄编号,按30只50只为一组,置70.C的液氮或干冰中保存,在2d内送交实验室。6.2. 1. 2 样晶制备将待检蚊虫样本每组分别用含青、链霉素的无菌生理盐水清洗三次,每组蚊样加入2.0mL BA-1稀释液后,在组织研磨器中研磨或置电动匀浆器中匀浆20s30 s,使样品匀浆成糊状,1000 r/min离心3 min,取上清液作为样品。6.2.2 RNA抽提在Eppendorf管内加入蚊样匀浆100L及300L酣-三氯甲烧混合液,涡旋1昆匀30s后;加入等量异丙醇沉淀RNA,10000
9、 r/min离心3min,吸去上清,将RNA沉淀重悬于100L不含RNA酶的纯水中,立即用于RT-PCR检测,剩余样品置一80.C低温保存。6.2.3 变性和退火将1L(30ng)引物VD8与10L重悬于纯水的样品RNA混合,95.C加热2min,立即置冰浴后,低速离心约5s,使液体集中在底部。6.2.4 cDNA合成在上述反应管中加入四种三磷酸脱氧核甘酸(dNTP)各0.2mmol/L、20IU RNA抑制剂(RNasin) ,和2IU禽成髓细胞瘤病毒(AMLV)逆转录酶,42.C反应1h,以扩增出模板cDNA。反应结束后,70.C 10 min灭活逆转录酶,立即置冰浴。6.2.5 PCR扩
10、增DNA取4LcDNA和46L反应缓冲液混合,其中含2mmol/L氯化馍,四种三磷酸脱氧核甘酸(dNTP)各0.5mmol/L , 300 ng引物VD8和变性引物EMF1(5 -TGGATGACSACKGARGAYATG-3S=C, G;K=G, T;R=A, G; Y=C, T)及O.5 IU Taq DNA聚合酶。95.C变性5min.将1昆合物进行30个PCR循环,95.C30 s , 53.C 90 s,随后72.C聚合10min。将1/200PCR扩增产物引用引物VD8和NS5YF进行半嵌套式PCR扩增。经过变性步骤,进行25个循环扩增DNA,94.C30 s , 55.C 60
11、s和72.C 120 s,在72.C延伸12m巾,最后4.C保温。6.2.6 设立对照在下列操作中应设立对照:在样品处理过程中应设立阳性样品对照、阴性样品对照和空白对照;一以感染黄热病毒的蚊虫匀浆提取RNA作为阳性对照;一一取正常未染毒的伊蚊匀浆提取RNA作为阴性对照;取等体积的水代替模板作为空白对照。6.2.7 琼脂糖凝胶电泳用TBE电泳缓冲液配制2%的琼脂糖(含O.5g/mL澳化乙链,EB)平板。将平板放入水平电泳槽,使电泳缓冲液刚好淹没胶面。将6L样品和2L样品缓冲液?昆匀后力IJ人样品孔。在电泳时设立DNA标准分子量作对照,推荐使用pUC19DNA/Msp( HpaII). 5 V /
12、cm电泳约0.5h,当澳酣蓝到达底部时停止。6.2.8 结果判定在紫外灯下观察核酸带并判断结果:一一-PCR后阳性对照会出现一条DNA片段带,阴性对照和空白对照没有该核酸带。DNA片段带的位置根据所选引物对的不同而不同。3 SN/T 1486-2004 一一-待测样品与阳性对照电泳后在相同位置出现特异性病毒核酸显色条带者为阳性。一一无核酸带或核酸带的大小不是相应bp数的为阴性。7 病毒分离鉴别与酶联免症眼附试验检测方法参见附录A。8 检测结果报告8. 1. 1 逆转录聚合酶链式反应法检测为阳性的,报告为检出黄热病毒特异性基因(RT-PCR法)。8. 1.2 血凝抑制试验(HI试验)检测阳性的,
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