DB37 T 3005-2017 猪流行性腹泻病毒分离与RT-PCR检测技术.pdf

《DB37 T 3005-2017 猪流行性腹泻病毒分离与RT-PCR检测技术.pdf》由会员分享，可在线阅读，更多相关《DB37 T 3005-2017 猪流行性腹泻病毒分离与RT-PCR检测技术.pdf（7页珍藏版）》请在麦多课文档分享上搜索。

1、ICS 11.220 B 41 DB37 山东省地方标准 DB37/T 30052017 猪流行性腹泻病毒分离与RT-PCR检测技术 Technology of Isolation and RT-PCR detection of Porcine Epidemic Diarrhea Virus 2017-08-18发布 2017-09-18实施 山东省质量技术监督局 发布 DB37/T 30052017 前 言 本标准按照GB/T 1.12009给出的规则起草。 本标准由山东省畜牧兽医局提出。 本标准由山东省畜牧业专业标准化技术委员会归口。 本标准主要起草单位：山东省农业科学院畜牧兽医研究所。

2、本标准主要起草人：吴家强、陈智、陈蕾、赵鹏伟、郭立辉、于江、李俊、杜以军、孙文博、丛晓 燕、时建立、王金宝。 本标准为首次发布。 I DB37/T 30052017 猪流行性腹泻病毒分离与RT-PCR检测技术 1 范围 本标准规定了猪流行性腹泻病毒分离与RT -PCR检测技术的要求。 本标准适用于猪肠道内容物、排泄物或乳汁样品中猪流行性腹泻病毒的分离与检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件，仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 3 缩

3、略语 下列缩略语适用于本文件。 DEPC水：DEPC（Diethy pyrocarbonate）处理并灭菌后的去离子水。 DMEM：细胞培养基（Dulbeccos Modified Eagles Medium）。 PEDV：猪流行性腹泻病毒（Porcine Epidemic Diarrhea Virus）。 双抗：青霉素、链霉素混合液（Penicillin-Streptomycin Solution）。 CPE：致细胞病变效应（cell cytopathic effect）。 4 仪器与试剂 除另有规定，本方法试验用水应符合GB/T 6682分析实验室用水规格和试验方法，所用化学试 剂应为分析

4、纯。 4.1 病毒分离需要的仪器与试剂 4.1.1 微量可调移液器（最大量程为10 L、20 L、100 L、1000 L）。 4.1.2 20000 g高速冷冻离心机。 4.1.3 高压灭菌锅。 4.1.4 37 二氧化碳细胞箱。 4.1.5 II级生物安全柜。 4.1.6 超低温冰箱：可控温至-70 。 4.1.7 PBS。 4.1.8 双抗（100）（青霉素10000 IU/mL，链霉素10000 g/mL）。 4.1.9 DMEM培养基。 4.1.10 Vero细胞。 4.1.11 新生胎牛血清。 1 DB37/T 30052017 4.1.12 胰酶。 4.1.13 一次性25 cm

5、 2 细胞培养瓶。 4.1.14 一次性10 mL吸管。 4.1.15 一次性0.22 m滤器。 4.1.16 1.5 mL离心管。 4.2 RT-PCR检测需要的仪器与试剂 4.2.1 微量可调移液器（最大量程为10 L、20 L、100 L、1000 L）。 4.2.2 20000 g高速冷冻离心机。 4.2.3 PCR仪。 4.2.4 高压灭菌锅。 4.2.5 普通冰箱。 4.2.6 超低温冰箱：可控温至-70 。 4.2.7 PBS。 4.2.8 1.5 mL离心管。 4.2.9 阳性对照：PEDV CV777疫苗毒株。 4.2.10 阴性对照：DEPC水。 4.2.11 引物：采用套

6、式PCR进行扩增，设计2对引物。PEDV外F 5-ACACCTATAGGGCGCCTGTA-3，PEDV 外R 5-AACCCTAAGAGGGGCATAGA-3，PEDV内F 5-GGGCGCCTGTATAGAGTTTA-3，PEDV内R 5-AGACCACCAAGAATGTGTCC-3。 5 方法 5.1 样品采集 5.1.1 活体采样 采集腹泻猪的排泄产物0.5 g0.7 g或采集乳汁0.5 mL0.7 mL。 5.1.2 病死猪采样 采集小肠肠道内容物1 g1.2 g。 5.2 样品处理 将样品按1:4的比例加入PBS，混匀并反复冻融23次后，以2000 r/min，4 离心5 min，

7、取上清， 12000 r/min 4 离心15 min，收取上清，过滤除菌置于-70 保存备用。 5.3 病毒分离与鉴定 取24 h生长良好的Vero单层细胞，弃掉培养液，用PBS洗细胞2次，按照每25 cm 2 培养瓶中加入200 L 的比例添加处理好的上清，同时加入终浓度为5 g/mL的胰酶，37 吸附1 h（注意期间每隔20 min轻 摇一次）。之后加入终浓度为5 g/mL胰酶的维持液（不含血清）。37 培养3 d，其间逐日观察。传 代的细胞培养物反复冻融3次，收取病毒液。用同样的方法盲传3代。每次传代均设不接病毒但含相同胰 酶浓度的对照组细胞。鉴定方法详见5.4。 5.4 病毒RT-P

8、CR检测技术 2 DB37/T 30052017 5.4.1 样品RNA的提取 5.4.1.1 取250 L处理后的样品或病毒培养物于1.5 mL离心管中，加入750 L Trizol充分混匀， 冰上静置5 min。 5.4.1.2 加入200 L三氯甲烷，剧烈震荡混匀，冰上放置5 min后，以12000 rpm 4 离心15 min。 5.4.1.3 吸取500 L上清转移至新1.5 mL离心管中，加入等体积异丙醇。-20 放置20 min，以12000 rpm 4 离心15 min。 5.4.1.4 弃去上清，用1 mL预冷的75 %乙醇轻轻冲洗1.5 mL离心管，以12000 rpm 4

9、 离心5 min。 5.4.1.5 弃去上清，以7500 rpm 4 离心5 min，吸取残留液体，在冰盒上静置5 min15 min，使 RNA干燥。 5.4.1.6 加入20 L DEPC水溶解RNA。立刻进行反转录，剩余RNA -70 保存。 5.5 第一链cDNA合成 5.5.1 反转录反应体系 反转录反应体系，详见附录B.1 5.5.2 反转录反应程序 将配好的反应体系轻轻混匀，如用Oligo(dT)18(0.1 g/L)，42 孵育30 min。如用Random Primer(N 9)(0.1 g/L)，25 孵育10 min，42 孵育30 min。85 加热5 min灭火反转录

10、酶。 5.5.3 PCR的条件 取1/10-1/5体积（2 L4 L）的反转录产物为PCR模板。每次PCR均应设立阳性对照与阴性对照 具体参数详见附录B.2。 外PCR反应条件：95 ，5 min；94 ，30 s；55 ，30 s；72 ，30 s；30 cycle；72 ， 10 min。 进行内PCR反应时，以外PCR产物为模板，进行套式扩增，反应条件与外PCR的反应条件一致。 6 结果判定 6.1 病毒分离检测 阴性对照应无CPE出现；样品接种细胞出现CPE，进一步做RT-PCR检测。 6.2 样品检测 阳性对照有420bp条带出现，阴性对照无420bp条带出现，实验成立。样品出现42

11、0bp条带判为阳性， 没有420bp条带判为阴性。 3 DB37/T 30052017 A A 附 录 A （资料性附录） 试剂的配制 A.1 75 %乙醇 无水乙醇 7 5 mL DEPC水 25 mL A.2 1 %琼脂糖凝胶 琼脂糖 0.6 g 0.5TAE缓冲液 60 mL A.3 细胞生长液 含10 %的胎牛血清和1 %双抗的DMEM。 A.4 胰酶 称取10 mg溶于10 mL去离子水中，充分溶解后0.22 m滤器过滤除菌，分装灭菌的1.5 mL离心管， -20 保存。 A.5 接种病毒后维持液 含1 %双抗的DMEM（不含血清）。 4 DB37/T 30052017 B B 附

12、录 B （规范性附录） RT-PCR反应体系 B.1 反转录反应体系 表B.1 反转录反应体系 成分1 2TS Reaction Mix 10 L 成分2 Random Primer(N19)(0.1 g/L) 1.0 L or Oligo(dT)18(0.1 g/L) 1.0 L 成分3 EasyScriptTM RT Enzyme Mix 1.0 L 成分4 RNA 50 ng5 g 成分5 DEPC水 补至20 L B.2 PCR反应体系 表B.2 PCR反应体系 成分1 cDNA 2L4 L 成分2 Forward Primer (10 M) 1.0L2.0 L Reverse Primer (10 M) 1.0L2.0 L 成分3 2TransTaq HiFi PCR Super Mix 25.0 L 成分4 DEPC水 补至50 L B.3 PCR反应程序 表B.3 PCR反应程序 温度 时间 步骤1 95 5 min 步骤2 94 30 s 55 30 s 72 30 s 步骤5 72 10 min 步骤2共运行30个循环。 _ 5