DB32 T 5319—2025 D1S1656等20个常染色体STR基因座等位基因频率参数.pdf
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1、7,江苏省市场监督管理局发 布中 国 标 准 出 版 社出 版D1S1656 等 20 个常染色体 STR 基因座等位基因频率参数Allelic frequency parameters of D1S1656 and another 19 autosomal short tandem repeat(STR)loci20251230 发布20260130 实施CCS C 06DB32/T 53192025ICS 11.100DB32/T 53192025前言 1 范围 12 规范性引用文件 13 术语和定义 14 数据统计与分析 25 群体遗传学参数 3参考文献7目 次DB32/T 53192
2、025前言本文件按照 GB/T 1.12020标准化工作导则 第 1 部分:标准化文件的结构和起草规则的规定起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由江苏省卫生健康委员会和江苏省司法厅联合提出并组织实施。本文件由江苏省卫生健康标准化技术委员会归口。本文件起草单位:江苏省人民医院、江苏省司法鉴定协会、南京市司法鉴定协会。本文件主要起草人:周惠英、叶琴、刘燕婷、张素华、潘猛、居晓斌、谢素梅、陈峰、冀强、高玉振、张运阁。DB32/T 53192025D1S1656 等 20 个常染色体 STR 基因座等位基因频率参数1范围本文件给出了江苏地区汉族人群 2
3、0 个常染色体 STR 基因座的等位基因频率参数。基因座包含:D1S1656、D2S441、D3S3045、D4S2366、D5S2500、D6S477、D7S3048、D8S1132、D9S925、D10S1435、D11S2368、D13S325、D14S608、D15S659、D17S1290、D18S535、D19S253、D20S470、D21S1270、D22GATA198B05。本文件适用于亲子关系鉴定、亲缘关系鉴定等法医物证鉴定中需要增加检测常染色体 STR 基因座的案件。2规范性引用文件下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅
4、该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T 43635 法庭科学 DNA 实验室检验规范SF/Z JD0105010 常染色体 STR 基因座的法医学参数计算规范3术语和定义下列术语和定义适用于本文件。3.1短串联重复序列short tandem repeat;STR广泛存在于真核生物基因组中,重复单位通常由 2 个6 个碱基构成,重复次数通常在 5 次60 次的 DNA 片段。来源:GB/T 443932024,3.13.2基因座locus基因在染色体的特定位置。来源:SF/Z JD01050102018,2.13.3等位基因all
5、ele位于同源染色体的同一位置上(同一基因座),控制同一性状的不同表现类型的基因。3.4HardyWeinberg 平衡定律HardyWeinberg equilibrium用于阐述繁殖对群体的基因频率和基因型频率的影响。注 1:该定律建立在一个理想的群体模式上,即群体无限大、随机婚配、没有突变及没有大规模的迁徙和没有选择因素的影响。1DB32/T 53192025注 2:结论是群体中的基因频率和基因型频率在逐代传递中保持不变。来源:SF/Z JD01050102018,2.7,有修改3.5等位基因频率allele frequency处于 HardyWeinberg 平衡状态的调查群体中,某种
6、等位基因数目占该基因座上所有等位基因数目的百分比。来源:SF/Z JD01050102018,3.3.23.6杂合度heterozygosity群体中某遗传标记所有基因型中杂合子所占的比例。注:杂合度高,说明该遗传标记的杂合性大,在法医学个人识别中的应用价值就大。来源:SF/Z JD01050102018,3.4.1,有修改3.7个体识别能力discrimination power;DP在调查群体中随机抽取两个体,二者的遗传标记基因型不相同的概率,是评价遗传标记系统识别不同个体效能大小的指标。来源:SF/Z JD01050102018,3.4.23.8非父排除概率probability of
7、exclusion;PE不是孩子生父的男子能够被某个遗传标记系统排除的概率,用于评估某一遗传标记系统在亲权鉴定案件中的实际价值。来源:SF/Z JD01050102018,3.4.33.9多态信息含量polymorphism information content;PIC遗传标记多态性可提供的信息量的度量。注 1:PIC 值介于 0 和 1 之间,越接近 1,则遗传标记的信息量越多。注 2:PIC 值取决于 STR 基因座上等位基因数目及频率分布。来源:SF/Z JD01050102018,3.4.4,有修改4数据统计与分析4.1仪器设备按照 GB/T 43635 中人类 DNA 性别及 ST
8、R 多态性分析所需设备要求执行。4.2样本来源筛选日常检案中江苏地区汉族人群无血缘关系个体样本,共计 5 025 份。4.3检测方法20 个常染色体 STR 基因座采用商品化的试剂盒复合扩增,扩增体系和扩增参数按照试剂盒说明书进行。扩增产物在基因分析仪上进行毛细管电泳分型,采用相关软件分析并获取等位基因数据。2DB32/T 531920254.4统计分析运用相关专业软件进行等位基因频率和法医学参数统计,按照 SF/Z JD0105010 中群体遗传学参数计算所示方法计算遗传学参数。5群体遗传学参数5.1等位基因频率参数经过统计分析获得 20 个常染色体 STR 基因座等位基因频率参数见表 1。
9、表 1 江苏地区汉族人群 20 个常染色体 STR 基因座等位基因频率参数(n=5 025)D1S1656等位基因9101112131414.114.31515.31616.116.31717.31818.31919.32020.3频率0.000 20.001 20.060 60.040 40.091 00.074 40.000 10.000 10.310 10.001 70.241 10.000 10.008 20.076 80.058 10.009 20.022 20.000 90.003 30.000 20.000 2D13S325等位基因121314.11515.11616.11718
10、1919.219.32020.321222324252626.327频率0.000 10.000 10.000 10.001 20.000 10.001 60.000 10.007 00.043 10.238 90.000 10.000 30.282 50.000 20.211 80.138 80.048 60.019 50.004 50.000 80.000 10.000 6D17S1290等位基因7891010.31111.31213141515.215.3161718192021频率0.000 20.000 90.037 50.044 60.000 10.012 80.000 10.01
11、2 30.015 30.222 10.298 20.000 10.000 10.172 90.113 90.046 90.014 00.006 80.001 2D20S470等位基因677.3891010.3111212.31313.31414.114.31515.31616.116.3171819202122频率0.001 20.000 10.000 30.001 20.022 20.140 70.000 10.031 30.043 10.000 50.124 10.000 50.139 20.000 10.000 40.163 90.000 50.183 00.000 10.000 10.
12、101 80.035 40.008 50.001 10.000 50.000 1D21S1270等位基因891010.3111212.31313.31414.31515.31616.31717.318频率0.000 20.000 10.002 40.001 30.300 00.068 20.000 30.041 40.089 90.091 00.035 90.252 80.007 20.099 00.002 60.007 00.000 40.000 33DB32/T 53192025D6S477等位基因99.21010.21111.21212.2131414.21515.21617181920
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