DB51 T 2758-2021 实验用小型猪 遗传质量控制.pdf

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1、ICS 65.020.30 CCS B 44 DB51 四 川 省 地 方 标 准 DB51/T 27582021 实验用小型猪 遗传质量控制 Genetic quality control of Experimental miniature pig 2021 - 02 - 10发布 2021 - 03 - 01实施 四川省市场监督管理局 发 布 DB51/T 5 2021 I 目 次 前言 . II 1 范围 . 1 2 规 范性 引用 文件 . 1 3 术 语和 定义 . 1 4 遗 传分 类及 命名 . 1 5 繁殖 . 2 6 遗 传质 量监 测 . 3 DB51/T 5 2021 I

2、I 前 言 本文件 按 照GB/T 1.1-2020 标 准化 工作 导则 第 1 部分： 标准 化文 件的 结构 和起草 规则 的 规 定 起草。 请注意 本文 件的 某些 内容 可能涉 及专 利。 本文 件的 发布机 构不 承担 识别 专利 的责任 。 本文件 由四 川省 科学 技术 厅提出 、归 口并 解释 。 本文件 起草 单位 ： 四川 省 农村科 技发 展中 心、四 川 大学 实 验动 物中 心 、四 川 省医学 科学 院四 川省 人民医 院实 验动 物研 究所 。 本文件 主要 起草 人： 王敬 东、陈兵 、 尹海 林、 邹弈 星、王 峥屹 、彭 旭 。 本文件 首次 发布 。

3、DB51/T 5 2021 1 实验用小型猪 遗传质量控制 1 范围 本文件 规定 了实 验用 小型 猪的遗 传分 类及 命名 、繁 殖、遗 传质 量监 测的 要求 。 本文件 适用 于实 验用 小型 猪的遗 传质 量控 制。 2 规范性引用文件 下列文 件的 内容 通过 文中 的规范 性引 用而 构成 本文 件必不 可少 的条 款。 其中 ，注日 期的 引用 文 件 ， 仅该日 期对 应的 版本 适用 于本文 件； 不注 日期 的引 用文件 ， 其 最新 版本 （包 括所有 的修 改单 ） 适 用 于 本 文件。 GB 14923 实验 动物 哺 乳 类实验 动物 的遗 传质 量控 制 NY

4、/T 1673 畜 禽微 卫星DNA 遗传 多样 性检 测技 术规 程 3 术语和定义 下列术 语和 定义 适用 于 本 文件。 3.1 实验用小型猪 experimental miniature pig 经人工 饲养 与培 育 ， 对 其 携带 微 生物 和寄 生虫 实行 控制 ， 遗 传背 景明 确或 者 来源清 楚 ，12 月龄 体重 小于50kg ， 用于 科学 研究 、教学 、生 产、 检验 检测 以及其 它科 学实 验的 小型 猪 。 3.2 近交系 inbred strain 经连续20代 及以 上的 全同 胞或亲 子近 交方 式培 育而 成， 品 系内 所有 个体 都可 追 溯

5、到起 源于 第20 代或 以后代 数的 一对 共同 祖先 。近交 系的 近交 系数 （inbreeding coefficient ） 应 大于98.6% 。 3.3 封闭群 closed colony 以非近 亲交 配方 式进 行繁 殖生产 的一 个动 物种 群， 在不从 外部 引入 新个 体的 条件下 ， 至 少连 续 繁 殖 4代以 上的 群体 。 4 遗传分类及命名 4.1 遗传分类 根据遗 传特 点的 不同 ，实 验用小 型猪 分为 近交 系和 封闭群 。 4.2 命名 4.2.1 近交系命名 DB51/T 5 2021 2 根据动 物的来 源、 历史和 培育经 过，以 一系 列字母

6、 和数字 作为品 系代 码（strain code ） 来表示 。 近交系 动物 通常 以一 个或 数个大 写英 文字 母表 示 （ 见示例1） ， 也 可以 采用 大 写英文 字母 加数 字命 名 （ 见 示例2 ）。 示例1 ： A DBA 示例2 ： C57BL C3H 4.2.2 近交代数 近交系 的近 交代 数用 大写 英文字 母F 表示 。 示例1 ：当 一个 近交 系的 近 交代数 为30 代时 ，写 成(F30) 。 4.2.3 其他近交系 亚系、 重组 近交 系、 同源 突变近 交系 、同 源导 入近 交系的 定义 和命 名按 照GB 14923 执行 。 4.2.4 封闭群

7、命名 封闭群 命名 按照GB 14923 执行。 5 繁殖 5.1 近交系的繁殖 5.1.1 原则 保持近 交系 实验 用小 型猪 的同基 因性 及基 因纯 合性 。 5.1.2 引种 应选择 来自 于近 交系 的基 础群， 遗传 背景 明确 ， 来 源清楚 ， 有 包括 品系 名称 、 近交 代数 、 遗 传 基 因 特点及 主要 生物 学特 征等 的完整 档案 。 5.1.3 方法 当近交 系实 验用 小型 猪生 产供应 数量 不是 很大 时 ， 一般不 设血 缘扩 大群 ， 仅 设基础 群和 生产 群 。 基 础群、 血缘 扩大 群和 生产 群的具 体繁 殖方 式按 照 GB 14923

8、 执行 。 5.2 封闭群的繁殖 5.2.1 原则 保持封 闭群 实验 用小 型猪 的遗传 异质 性及 基因 多态 性，避 免近 交系 数随 繁殖 代数增 加而 过 快 上 升 。 5.2.2 引种 5.2.2.1 应遗传 背景 明确 ，来 源清 楚，有 较完 整的 档案 （包 括种群 名称 、来 源、 遗传 基因特 点及 主要 生物学 特征 等）。 DB51/T 5 2021 3 5.2.2.2 根据繁 殖方 式， 在保 证每 代近交 系数 增量 不大 于 1 的前 提下 ，决 定最 小引 种规模 。宜 采用 循环交 配方 式， 引种 数量 不应少 于 13 对 无血 缘关 系 （三代 以内

9、 无共 同祖 先） 的种猪 ；也 可采 用随 机交 配方式 ，引 种数 量不 应少 于 25 对无 血缘 关系 的种 猪 。 5.2.3 方法 具体繁 殖方 法按照GB 14923 执行 。 6 遗传质量监测 6.1 监测方法 采用微 卫星DNA标记 检测 方 法。具 体方法 按照NY/T 1673 执行 ，各微 卫星DNA标 记 的染色 体位置 、等 位基因 数、 等位 基因 片段 范围、 引物 序列 、荧 光标 记、退 火温 度、 镁离 子浓 度等见 表1 。 表1 各微卫星 DNA分子标记检测条件列表 分子标 记名称 染色体 位置 等位 基因数 （个） 等位基 因 片段范 围 （bp）

10、荧光 标记 引物序 列 5 3 退火 温度 （） 镁离 子浓 度 (mM) S0155 1 7 148-164 FAW F-TGTTCTCTGTTTCTCCTCTGTTTG R-AAAGTGGAAAGAGTCAATGGCTAT 58 1.5 S0010 2 9 102-124 FAW F-TTAACATGGCTGTCTGGACC R-GTCCCTGTCCAACCATAAGA 60 1.5 SW349 3 21 148-184 FAW F-CCTGTTGTAGGCTCCATGAG R-CTAGGAGTCGGCCCTGAAC 62 1.5 S0001 4 6 175-189 FAW F-TGGAT

11、GGGTCTCATTCTCAG R-TGATTCCTAGCCTGAGAAGC 50 1.5 S0005 5 10 200-248 FAW F-TCCTTCCCTCCTGGTAACTA R-GCACTTCCTGATTCTGGGTA 55 3.0 S0087 6 17 161-220 FAW F-GACAAGCTCCAGGAAGCTTTCCTG R-ATTGCCTTGTGATCCCAAGGGGCA 58 1.5 S0101 7 13 196-230 FAW F-GAATGCAAAGAGTTCAGTGTAGG R-GTCTCCCTCACACTTACCGCAG 58 1.5 S0225 8 7 170

12、-194 HEX F-GCTAATGCCAGAGAAATGCAGA R-CAGGTGGAAAGAATGGAATGAA 58 1.5 SW174 9 5 123-136 TAMRA F-GCCAAAATAGCTATTGGACAGC R-TCATGCTATTTTGTTCCAGATG 58 1.5 SW1626 10 14 117-170 FAW F-GCCAATTTCTAGCAAAGTGACC R-TGGAAGATGACATAAGAAAGGG 62 1.5 DB51/T 5 2021 4 表1 各微卫星DNA分子标记检测条件列表（续） 分子标 记名称 染色体 位置 等位 基因数 （个） 等位基 因

13、 片段范 围 （bp） 荧光 标记 引物序 列 5 3 退火 温度 （） 镁离子 浓度 (mM) S0009 11 9 96-133 FAW F-AAACATACCAAGAAGCCCAG R-TAATCTTTGCCATCCCTTGT 62 1.5 SW605 12 5 109-135 TAMRA F-AGCCTTCTGTGCAGAAAAGC R-CCCCAGGTTCTCTGCTCTC 58 1.5 SW769 13 7 104-139 HEX F-GGTATGACCAAAAGTCCTGGG R-TCTGCTATGTGGGAAGAATGC 55 3.0 SW857 14 6 134-160 TA

14、MRA F-TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC R-GATCCTCCTCCAAATCCCAT 55 1.5 S0355 15 14 243-277 HEX F-TCTGGCTCCTACACTCCTTCTTGAT G R-TTGGGTGGGTGCTGAAAAATAGGA 55 3.0 S0026 16 5 90-111 FAW F-AACCTTCCCTTCCCAATCAC R-CACAGACTGCTTTTTACTCC 58 1.5 S0332 17 24 111-168 FAW F-TGGTTTCCTCACCAAGACAAGTAC R-CCCAAGGAGCTACAGCAAGGCAAG

15、 58 1.5 SW1984 18 21 95-158 FAW F-TTTTTAGTGTCCAAGGAGGTCC R-GGAGCACTAATAGACCACCACC 55 1.5 SW2476 X 6 88-106 TAMRA F-CTGGAGCAGGAGAAAGTAAGTTC R-GGACAGTTACAGACAGAAGAAGG 62 1.5 注：F 表示正向引物 ，R 表示反向引 物 。 6.2 近交系遗传质量监测 6.2.1 时间间隔 对生产 群， 每2 年至 少进 行1次。 6.2.2 抽样 对基础 群， 凡在 子代 留有 种猪的 双亲 动物 都应 该进 行检测 。 对生产 群， 按照 表

16、2 要求 从 每个近 交系 中随 机抽 取非 同窝成 年实 验用 小型 猪， 公母各 半。 表2 近交系实验用小型猪生产群遗传监测抽样要求 单位： 头 群体规 模 抽样数 量 50 4 50100(含) 6 100 不少 于6% DB51/T 5 2021 5 6.2.3 结果判定 结果判 定按 照表3执 行。 表3 近交系实验用小型猪遗传质量监测结果判定 监测结 果 判定 与标准 遗传 概貌 完全 一致 未发现 遗传 变异 有一个 位点 的标 记基 因与 标准遗 传概 貌不 一致 遗传发 生变 异 6.2.4 判定结论 所有样 品检 测位 点的 等位 基因都 符合 品系 的特 征， 没 有新

17、的 等位 基因 出现 判为 合格的 实验 用小 型 猪 近交系 ，否 则判 为不 合格 。 6.3 封闭群遗传质量监测 6.3.1 时间间隔 对生产 群， 每年 至少 进行1 次。 6.3.2 抽样 选择6 月龄 以上 的实 验用 小 型猪用 于检 测， 随机 抽样 。 表4 封闭群实验用小型猪遗传质量监测抽样要求 单位： 头 群体规 模 抽样数 量 100 不少 于10 头 100 不少 于20 头 6.3.3 结果判定 结果判 定按 照表5执行 。 表5 封闭群实验用小型猪遗传质量监测结果判定 监测结 果 判定 达到平 衡状 态 未发现 遗传 变异 没有达 到平 衡状 态 遗传发 生变 异 注：平衡状态 判定方法见NY/T 1673 。 6.3.4 判定结论 所有检 测基 因 （ 型） 频率 没有发 生超 出规 定的 变化 ， 群体 内达 到相 对平 衡的 状态， 判为 合格 的 实 验 用小型 猪封 闭群 ，否 则判 为不合 格。 _