SN T 5333-2020 玉米霜霉病菌(非中国种)检疫鉴定方法.pdf
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1、以正式出版文本为准 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T 5333 2020 玉米霜霉病菌(非中国种) 检疫鉴定方法 RDetection and identification of Peronosclerospora spp. (non-Chinese) 2020-12-30 发布 2021-07-01 实施 ICS 65.020.01 CCS B 16 中华人民共和国海关总署发 布 以正式出版文本为准 以正式出版文本为准 SN/T 5333 2020 I 前 言 本文件按照 GB/T1.12020 给出的规则起草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布结构不承担识别这
2、些专利的责任。 本文件由中华人民共和国海关总署提出并归口。 本文件起草单位:中国检验检疫科学研究院、长沙海关技术中心、河口海关。 本文件起草人:吴品珊、罗志萍、雷荣、段禄华、陈岩。 以正式出版文本为准 以正式出版文本为准 1 SN/T 5333 2020 玉米霜霉病菌(非中国种) 检疫鉴定方法 1 范围 本文件规定了爪哇霜霉病菌、菲律宾霜霉病菌、甘蔗霜霉病菌和高粱霜霉病菌 4 种玉米霜霉病菌 非中国种的检疫鉴定方法。 本文件适用于玉米、高粱和甘蔗等禾本科植物的植株及种子中玉米霜霉病菌(非中国种)的检疫 和鉴定。 2 规范性引用文件 本文件没有规范性引用文件。 3 术语和定义 本文件没有需要界定
3、的术语和定义。 4 病菌的基本信息 学名: Peronosclerospora spp. 分类地位:藻菌界 Chromista,卵菌门 Oomycota ,霜霉纲 Peronosporea ,霜霉目 Peronosporales, 霜霉科 Peronosporaceae ,霜指霉属 Peronosclerospora 。 玉米霜霉病菌(非中国种)指霜指霉属( Peronosclerospora)中的爪哇霜霉病菌( P. maydis)、 菲 律宾霜霉病菌( P. philippinensis)、甘蔗霜霉病菌( P. sacchari)和高粱霜霉病菌( P. sorghi),它们专 性寄生于玉米
4、、高粱和甘蔗等禾本科植物上,在热带和亚热带危害严重。 传播途径:病菌主要在野生寄主上越冬,翌年侵染玉米等寄主作物。病菌近距离传播主要靠染病 叶片上的分生孢子或卵孢子,远距离传播主要靠寄主植物插条、高粱种子、种子中夹带的病残体或新 鲜湿润的种子。 玉米霜霉病菌(非中国种)的其它信息参见附录 A。 5 方法原理 根据玉米霜霉病菌(非中国种)4 种病原菌的形态学特征和分子生物学特性,利用通用引物和特 异性引物进行 PCR 扩增并测序比对的原理,对病菌进行综合检疫鉴定。 6 仪器设备和主要试剂 6.1 仪器设备 生物显微镜(具测量功能),体视显微镜,超净工作台,天平,高压灭菌锅,台式高速离心机, 以正
5、式出版文本为准 2 SN/T 5333 2020 pH 计,低温冰箱、常规冰箱、水浴箱, PCR 扩增仪,电泳仪,凝胶成像仪。 6.2 主要试剂 除另有规定外,所有试剂均为分析纯。席尔氏浮载剂,乳酚油,氢氧化钠,苯胺蓝,PCR缓冲液、 dNTPs (dATP、dTTP、dCTP、dGTP)、 Taq DNA 聚合酶,dNTPs,通用引物 ITS5/ ITS4,特异性引物引 物 Pssm -2/Pssm-3 和特异性引物 Pmly -1/Pmly-2。 7 检疫鉴定方法 7.1 症状检查 4 种病菌在寄主植株上引致的症状近似。观察玉米、甘蔗和高粱叶片是否有褪绿色条斑,叶基部 是否变黄,叶背面是否
6、有白色霉层(参见附录 A)。 检查挑取瘦小、霉变、畸形的种子,以及种子中夹带的病残体、高粱颖壳,观察是否有病斑, 病斑是否有霉层。 7.2 形态学鉴定 对于有霉层的病斑,直接挑取病菌分生孢子囊和孢囊梗制片镜检,或用小块透明胶带粘取霉层 制片镜检。观测记录分生孢子囊和孢囊梗的形状、大小,分生孢子囊至少测量 30 个。 7.3 组织透明检测 取病残体、种皮、种子的颖壳,在 10% 氢氧化钠中煮沸透明 1020min,苯胺蓝染色、镜检,观 察菌丝形态和卵孢子。 7.4 分子生物学鉴定 7.4.1 DNA 提取 对于有霉层的病组织,直接搜集病菌提取 DNA ;对于无霉层的病组织,取病变部位用液氮研磨,
7、 然后提取 DNA。 按 CTAB 方法提取 DNA 参见附录 B。 7.4.2 PCR 反应及序列比对 对于病菌DNA,利用真菌通用引物ITS5(5 -GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3) 和 ITS4 (5 -TCCTCCGCT- TATTGATATGC-3)进行扩增,然后测序。 对于病组织的 DNA,用特异性引物引物 Pssm -2/Pssm-3(Pssm -2 :5 -GTGAAGGCTAGCGGCTT-3, Pssm- 3 :5 -AGAGACTTTCGTCCCCACAG- 3 ) 或 Pmly - 1/Pmly- 2(Pmly - 1 :5 - GGATGTCTGCG
8、ATCATCGATTTGAA-3,Pmly -2 :5 -ATCCAGGAGACTTTTCCAACTTAAT-3)进行扩 增,然后测序。 PCR 反应程序参见附录 C。 将获得的序列与NCBI网站Genbank中公开发表的 Peronosclerospora maydis、 Peronosclerospora philippinensis、 Peronosclerospora sacchari 和 Peronosclerospora sorghi 的序列进行相似性比对分析。 以正式出版文本为准 3 SN/T 5333 2020 8 鉴定特征 8.1 症状特征 玉米受侵染后全株呈淡绿色,逐渐变为
9、黄色或浅黄色,直至枯死。成株受害,多自中部叶片的基 部开始发病,叶基部褪绿或产生退绿条斑,逐渐向上蔓延,形成淡黄至白色条斑、黄绿相间的条纹, 严重时叶片全部失绿。潮湿情况下,叶背面可见病菌霉层。 甘蔗病株矮化、茎细小,叶窄直立,叶条纹颜色绿黄或黄,逐渐变为红褐色或深红色。 高粱病株叶片窄、较为直立,叶基部黄化,直至整个叶片出现黄白色长条纹,潮湿时在叶片黄 化部位的上下表现均可出现白色霉层。 8.2 形态学特征 Peronosclerospora maydis :菌丝体无色多核,菌丝有不同形状的吸器。孢囊梗自气孔伸出,无色, 基部细,有一隔膜,上部肥大,双分叉 24 次,整体呈圆锥形,梗长 15
10、0550 m,小梗近圆锥形弯 曲,顶生一个分生孢子囊。分生孢子囊无色,长椭圆形至近球形,大小为 1626 m1520 m,萌发 生芽管。未发现卵孢子。 Peronosclerospora philippinensis :菌丝体无色多核,不规则收缩与膨大,吸器简单,泡囊状至近指 状,28 m。孢囊梗自气孔伸出,无色,长150400 m,双分枝24次,分枝粗壮,小梗锥形,稍弯, 长 10 m。分生孢子囊无色,长卵形至圆柱形,顶端稍圆,大小为 2739 m1721 m,萌发生芽管。 卵孢子罕见,球形,壁光滑,直径 15.322.6 m。 Peronosclerospora sacchari :菌丝体
11、无色多核。孢子囊单个或成双从气孔伸出,无色直立,长 160170m,基部略细,宽 1015 m,有足细胞,向上渐粗约为基部的23倍,02隔膜,上 部双分枝23次。分生孢子囊无色,椭圆、长椭圆或长卵形,顶端圆,基部稍尖或圆,大小 为 2541 m1523 m,萌发生芽管。卵孢子黄色,球形或稍呈多角形,直径4050 m,壁厚 3.85m。 Peronosclerospora sorghi :菌丝体无色多核。孢囊梗直立,无色,长为 180300 m,有足细胞,顶 端二叉分枝 13 次,分枝粗短常排列成半球形,小梗尖,顶生一个分生孢子囊。分生孢子囊近圆形, 大小为 1526.9 m1528.9 m,萌
12、发生芽管。卵孢子无色球形,大小为 2542.9 m,平均 36 m,具 有淡黄色外壁。 病菌形态图和 4 个近似种的形态比较参见附录 A。 8.3 序列对和 PCR 特异性产物 通用引物 PCR 扩增片段大小约为 442bp,测序结果与 NCBI 网站 Genbank 中 Peronosclerospora maydis、 Peronosclerospora philippinensis、 Peronosclerospora sacchari和 Peronosclerospora sorghi的序列比对, 相似性应为 98% 以上。 特异性引物 Pssm-2/ Pssm-3 扩增出的目标片段大
13、小为 120bp 左右;引物 Pmly-1/Pmly-2 扩 增的目标片段大小为 200bp 左右。测序结果与 NCBI 网站 Genbank 中 Peronosclerospora maydis、 Peronosclerospora philippinensis、 Peronosclerospora sacchari 和 Peronosclerospora sorghi 的序列比对,相似 性应为 98% 以上。 9 结果判定 寄主植株的症状和病菌形态与 8.1 和 8.2 描述的一致,且通用引物 PCR 扩增 ITS 基因的测序比 以正式出版文本为准 4 SN/T 5333 2020 对结果
14、与 Genbank 数据库中 4 种玉米霜霉病菌中的任何 1 种基因序列性超过 98% 即可视为同一种 真菌。 病残体和种子颖壳或种皮中的病菌与 8.2 描述的一致,且特异性引物 PCR 扩增的测序比对结果 与Genbank数据库中4种玉米霜霉病菌中的任何1种基因序列相似性超过98%即可视为同一种真菌。 10 样品保存和记录 10.1 样品保存与处理 样品经登记和经手人签字后妥善保存。对检出玉米霜霉病菌(非中国种)的样品应保存于 4 冰 箱中,以备复核。该类样品保存期满后须经高压灭菌后方可处理。 10.2 结果记录与资料保存 完整的实验记录包括:样品的来源、种类、时间,实验的时间、地点、方法和
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