DB15 T 1491-2018 油菜籽(种子)中细菌性黑斑病菌检测方法.pdf
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1、 ICS 65.020.01 B 16 备案号: 60274-2019 DB15 内 蒙 古 自 治 区 地 方 标 准 DB15/T 1491 2018 油菜籽 (种子 )中细菌性黑斑病菌检测方法 Detection methods for Pseudomonas syringae pv. maculicola in Rapeseed(Seeds) 2018-09-30 发布 2018-12-30 实施 内蒙古自治区质量技术监督局 发布 DB15/T 1491 2018 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1-2009给出的规则起草 。 本标准由二 连浩特出入境检验检疫局技术中心提出 。
2、本标准由内蒙古自治区质量技术监督局归口 。 本标准起草单位:中华人民共和国二连浩特出入境检验检疫局技术中心、中华人民共和国南海出入 境检验检疫局技术中心、中华人民共和国满洲里出入境检验检疫局技术中心 。 本标准主要起草人:袁淑珍、张永宏、张志峰、李凯兵、刘玮琦、魏宇虹、李菁雯 。 DB15/T 1491 2018 1 油菜籽 (种子 )中细菌性黑斑病菌检测方法 1 范围 本标准规定了油菜籽 (种子 )中细菌性黑斑病菌的鉴定、检测结果判定等要求 。 本标准适用于油菜籽 (种子 )中细菌性黑斑病菌的检测方法 。 2 规范性引用文件 下列文件 对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所
3、注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件 。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件 。 3.1 细菌性黑斑病菌 Bacterial black spot 学名 : Pseudomonas syringae pv Maculicola,简称 PSM。 中文名 :丁香假单胞杆菌斑生致病变种 。 该病菌属于原核生物界 Procaryotae,薄壁菌门 Gracilicutes,假单 胞菌科 Pseudomonadaceae。 4 病菌的鉴定 4.1 PCR 初筛 4.1.1 样品 DNA 提
4、取 从油菜籽 (种子 )样品中取 200 g用作检测样品。在样品中加入 350 mL生理盐水, 4 浸泡过夜;纱 布过滤,滤液 10000 r/min离心 15 min, 1 mL灭菌水悬浮沉淀,转入 EP管 12 000 r/min离心 5 min,沉淀 用于提取 DNA。用细菌 DNA提取试剂盒提取 DNA。重复 3次 。 4.1.2 PCR 检测 分别取 2 L样品 DNA,检测 hrpZ基因和冠毒素基因,分别进行 PCR扩增。用十字花科黑斑病菌标准 菌株 DNA作阳性对照,用灭菌 蒸馏水作空白对照 。 hrpZ基因检测引物 MM5F(5-gaacgagctgaaggaagaca-3)/
5、5R(5-cagcctggttagtctggtta-3),预期扩增产物 532 bp;冠毒素基因检测引物 cfl F(5-ggcgctccctcgcactt-3)/R(5-ggtattggcgggggtgc-3),预期扩增产物 670 bp。 PCR反应体系 : PCR反应总体积为 30 L, 包含: 10 mmol/L Tris-HCl; 50 mmol/L KCl( pH 8.3); 1.5 mmol/L MgCl2; dATP、 dGTP、 dCTP、 dTTP浓度均为 100 mol/L;引物浓度各为 100 nmol/L;模板 DB15/T 1491 2018 2 DNA为 2 L;
6、 1.5 U Taq DNA聚合酶。反应程序为: 94 3 min; 94 30 s, 57 (引物 cfl F/R为 67 ) 30 s, 72 45 s,循环 35次;最后 57 5 min。 4.1.3 电泳分析 扩增产物电泳, EB染色后用凝胶成像系统分析 。 取 10 L扩增产物与 3 L 6上样缓冲液混合均匀,在 1.5 %琼脂糖凝胶 1 TAE缓冲液中 (4 V-6 V/cm)电泳 30 min,核酸染料染色后凝胶成像系统分析。如果 PCR初筛结果 2对引物扩增均为阳性,需继 续以下验证 。 4.2 分离培养 4.2.1 菌悬液制备 如油菜籽 (种子 )样品 PCR初检为阳性,另
7、取样品 50 g,加入 100 mL 生理盐水, 4 浸泡过夜;纱布 过滤,滤液 10000 r/min离心 20 min, 1 mL灭菌水悬浮沉淀,沉淀悬浮液 10倍系列稀释备用 。 4.2.2 病原菌分离 分别取稀释 10倍、 100倍和 1000倍菌悬液各 100 L涂布 MT培养基平板,每个稀释度 10次重复。 MT 平板置于 26 培养箱内培养 3 d 4 d,挑取疑似菌落在 KB培养基上纯化三次用于后续检测 。 4.3 菌落特征鉴 定 油菜籽 (种子 )提取液在 MT培养基上培养 3 d后, PSM的典型菌落特征为乳白色,圆形至椭圆形,表面 干扁;菌落周围无透明水解圈。培养 4 d
8、 7 d后,菌落周围出现小而模糊的水解圈。 4.4 PCR 检测和产物序列分析 对疑似菌落在 KB培养基上纯化后,无菌水洗脱,取菌液 1 mL, 12000 r/min离心 5 min,收集菌体, 用细菌 DNA提取试剂盒提取 DNA。按照 4.1.2中的方法进行 PCR 检测。扩增产物约为 307 bp,测序结果与 GenBank中 PSM菌株和相关菌株做序列相似性比对分析 。 4.5 致病性测试 选取与 PSM菌落形态特征相符且 PCR检测阳性的分离物,用无菌水配成 108 CFU mL的菌悬液,无菌 棉签蘸取菌悬液均匀涂布接种四周龄健康油菜幼苗嫩叶,以无菌水作为对照,幼苗接种后保湿 24
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