DB37 T 1797-2011 实验室信息管理系统指南.PDF
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1、 ICS 35.240.20 L67 DB37 山东省地方标准 DB 37/T 17972011 实验室信息管理系统指南 2011 -01 -14 发布 2011-02 -01 实施 山东省质量技术监督局 发布 目 次 前言 . II 1 范围 . 1 2 规范性引用文件 . 1 3 术语和定义 . 1 4 符号和缩略语 . 2 5 实验室信息管理系统建模 . 2 5.1 LIMS总体建模构架 . 2 5.2 LIMS核心建模构架 . 3 5.3 LIMS的生命周期阶段 . 4 5.4 行业部门的LIMS建模 . 6 6 LIMS的工作流程和采样周期 . 7 6.1 LIMS工作流程介绍 .
2、7 6.2 LIMS的基本工作流程 . 7 6.3 LIMS功能区 . 7 6.4 LIMS 数据模型 . 13 7 LIMS基础设施、集成和界面 . 14 7.1 硬件/平台 . 14 7.2 数据库介绍 . 15 7.3 LIMS应用平台 . 16 7.4 LIMS的自定义和集成 . 17 7.5 企业计算架构 . 20 7.6 LIMS和ERP系统之间的数据交换 . 23 7.7 基础设施集成 . 24 7.8 工作流集成 . 25 7.9 工业数据交换技术 . 25 7.10 企业应用集成和中间件 . 25 7.11 数字内容 . 25 8 LIMS生命周期 . 26 8.1 引言 .
3、 26 8.2 第1 阶段-项目启动 . 33 8.3 第2 阶段-需求分析 . 33 8.4 第3 阶段-系统设计 . 35 8.5 第4 阶段-建立/配置 . 36 8.6 第5 阶段-测试/自定义 . 38 8.7 第6 阶段-运行维护阶段 . 39 8.8 第7 阶段-系统恢复 . 40 参考文献 . 42 DB37/T 1797-2010 II 前 言 本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。 本标准由山东省质量技术监督局提出。 本标准由山东省信息标准化技术委员会归口。 本标准起草单位:山东省标准化研究院等。 本标准主要起草人:桓德铭、熊绍东、张欣、刘含强。 DB37/T
4、 1797-2010 1 实验室信息管理系统指南 1 范围 本标准对实验室信息管理系统建模、工作流程和采样周期、系统基础设施、集成和界面以及系统生 命周期各阶段进行了共性需求的归纳和总结,给出了实验室信息管理系统可以采用的技术指南。 本文件适用于以下对象: a) 实验室信息管理系统的使用方; b) 实验室信息管理系统的集成方; c) 实验室信息管理系统的开发商; d) 实验室信息管理系统的监理单位; e) 实验室仪器供应商。 以上对象以外的相关单位、厂商、个人也可参照使用。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注
5、日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 9385 计算机软件需求规格说明规范 GB/T 9386 计算机软件测试文档编制规范 GB/T 15532 计算机软件测试规范 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 实验室管理信息系统 实验室管理信息系统是一种可以在实验室采集、分析、报告和管理数据与信息的软件和硬件。 3.2 实验室信息管理系统配置 指的是在特定的实验室里为使用LIMS所做的准备活动。它通常需要使用供应商提供界面,以输入描 述各类样品、分析方法、规格等在实验室中使用的资料。 3.3 实验室用户信息管理系统 指的是经过定制的实验室信息管理系统
6、,以满足某一特定实验室要求的过程。它通常需要添加表, 修改表结构和编写代码或程序,以改变该实验室信息管理系统的适用性。 DB37/T 1797-2010 2 3.4 基本数据结构 名称、数据结构长度、小数位数、正负号等基本信息的明确规定。 3.5 光谱数据系统 对从光谱和非色谱仪器中得到的信息进行处理、显示、解释、存储和报告的计算机系统。 3.6 静态表 描述实验室信息管理系统数据库表在模板、测试、计算、规格以及定义和存储的有关信息,为实验 项目固有参数列表,又可称为实验项目外围参数综合表。 4 符号和缩略语 下列缩略语适用于本文件。 LIMS 实验室管理信息系统 Labora tory In
7、formation Management Systems LC LIMS核心功能 Core LIMS functions API 应用程序接口 Ap plication Programming Interfaces SOAP 简单对象访问协议 Sim ple Object Access Protocol RFP 需求提案书 Request for Proposals SDD 系统设计文件 The Sy stem Design Document CAPA 标样标定与误差修正系统 Correct ive Action and Preventative Action CDS 色谱数据系统 Chrom
8、a tography Data System EDMS 电子文件管理系统 Electronic Do cument Management Systems ELN 电子数据网络发布系统 Electronic Laboratory Notebooks ERP 企业资源计划 Enterprise Resource Planning GAMP 良好自动化制造实践 Good A utomated Manufacture Practice LES 实验室管理执行系统 Laborator y Execution System SDMS 科学数据管理系统 Scientific D ata Management
9、 Systems 5 实验室信息管理系统建模 5.1 LIMS 总体建模构架 LIMS的核心功能涵盖范围广泛,涉及到实验室的工作流程,信息管理和与其他企业计算机系统的集 成。有关LIMS与一些外部系统、仪器、报告工具、自动化测试工具的集成,LIMS的逻辑单元对这些核心 功能做出了说明。 DB37/T 1797-2010 3 规划和规划前 审核 电子数据网络发布系统 简单系统 复杂系统 数据存储 调查 网页入口 用户认证 文档管理 企业资源计划 制造执行系统 LIMS 实验室信息管理系统 测试工具回归测试,压力测试和容量测试 报告 注1:LIMS 主要功能、集成点如图 1 所示。 图1 LIMS
10、 总体建模构架 5.2 LIMS 核心建模构架 实验室信息管理系统的功能、扩展功能、与外部系统的关联以及未来实验室信息管理系统的功能, 如表1所示。 5.2.1 LIMS 的核心功能包括 LC-1 的实施和LC-2 的支持两个部分。 5.2.2 实验室信息管理系统的扩展功能在逻辑单元图中以项目列表 LE 的形式来描述。 5.2.3 实验室信息管理系统的外部系统在逻辑单元图中以项目列表 E 的形式来描述。 5.2.4 实验室信息管理系统未来的功能在逻辑单元图中以项目列表 LF 的形式来描述。 表 1 LIMS 核心建模构架 标准流程 特殊点 测试方法 测试材料 配置管理(LC-2.1) 收集源文
11、件 过程改变控制 创建主数据 测试/验证主数据 转移主数据到产品上 主数据报废 样本登录(LC-1.1) 实验室服务请求 登录相关事务 登录样本 打印登录样本 报告提交(LC-2.2) 硬件管理 软件管理 数据管理 错误恢复 DB37/T 1797-2010 4 表 1 LIMS 核心建模构架( 续 ) 资源管理(LE-1) 分析培训记录 质量状态 样本管理(LC-1.2) 接收样本 分发样本 存储样本 样本链管理 现实状况管理(LE-2) 电子报告 电子签名 个人隐私 金融法规 设备管理(LE-3) 校准管理 维护 服务/修复管理 实验室核心工作流程(LC-1.3) 安排分析 配置设备 测试
12、准备 执行测试 数据输入 物品管理(LE-2) 创建 检查 丢弃 仪器数据采集(LE-6) 图形数据系统 直接数据解析采集 文件/解析采集 数据库类型数据解析采集 结果检查(LC-1.4) 数据检查 数据验证,保证数据的合法 性 已安排好事务的管理(LE-5) 环境 状态 标准和试剂管理(LE-7) 系统的整合(E-2) 实验室管理执行系统 企业资源计划 生产执行系统文档管理 静态分析 跨应用程序分析 标准作业指导书(发布版) (LC-1.5) 清单管理(LE-8) 已被使用的物质 试剂 稳定性 投资管理(LE-9) 控制图趋势(LE-10) LIMS数据存档(LC-2.3) 验证LIMS(E
13、-4) 质量认证 检查认证 报告(LC-1.6) 实验室核心工作流程 实验室指标 特案报告 凭证分析 管理报告 未来实验室计划(LF-1) 注2:LC=LIMS主要功能 1.0=实施 2.0=支持 注3:E=外部系统 注4:LE=LIMS扩展功能 注5:LF=LIMS未来功能 5.3 LIMS 的生命周期阶段 实验室信息管理系统(高层)的生命周期阶段如表2所示,包括: 系统实施的启动阶段 系统的运行阶段 系统维护的阶段 这些主要阶段进一步细分为一些主要职能。编号与LIMS核心建模构架定义相匹配。 DB37/T 1797-2010 5 表2 LIMS 构建规划 启动实验室信息管理系统执行 运行
14、LC-1.1 登录 LC-1.2样 本管理 LC-1.3实 验室核心 工作流程 LC-1.4检 测 LC-1.6报 告 LC-2.3 存档 LC-2.1系 统报废 LC-1.5公 布 LC-1.6.3 商业报告 LC-1.6.4 管理报告 LC-1.6.2 实施 分析证书 LC-1.6.1 特别 报告 LC-1.4.2 数据验证 LC-1.4.1 数据 检查 LC-1.3.4 自动数据输入 LC-1.3.3 手动 数据输入 LC-1.3.2 设备 分配 LC-1.3.1 任务 分派 LC-1.2.3 报告 LC-1.2.2 样本 分发 LC-1.2.1 样本 接收 LC-1.1.5 标签 LC
15、-1.1.4 实施 测试规格 LC-1.1.3 实施 测试组 LC-1.1.2 样本 的手动登录 LC-1.1.1 样本 的自动登录 SC-2 设计 SC-1 项目 启动需求 分析 SC-3 建立/ 配置 SC-4 数据加载 SC-5 质量 认证和检验 SC.4.3 系统安全 SC.4.4 从外部系统中,手 动/自动的加载数据 LC-2.3.5 历史趋势 LC-2.3.3 数据恢复 LC-2.3.4 丢弃 LC-2.3.2 配 置/自定义代 LC-2.3.1 数据 数据迁移 SC.4.2 管理请求 SC.4.1 检查合 同 SC.3.2 变更控制 SC.3.1 代码规 范 SC.1.7 签订合
16、同 SC.2.1 检查合同 SC.2.3 验证 SC.2.4 进行指定配置 SC.2.5 改变控制 SC.2.6 检查合同 SC.2.8 验证/ 源代码 SC.2.7 收集/ 创建 SC.2.2 收集/ 创建 SC.1.6 商议合同 SC.1.5 供应商认证体制 SC.1.4 评估 SC.1.3 系统演示 SC.1.2 检测、 评价 SC.1.1收集/ 创 建并且发送 DB37/T 1797-2010 6 表2 LIMS 构建规划( 续 ) 维护 SM-1 硬件 维护 SM-2 系统 维护 SM-4 灾难 恢复 SM-3 数据 维护 SM.3.1 数据恢复 SM.2.3 支持/ 恢复 SM.2
17、.4 网络 SM.2.9 格式化 SM.2.8 安全跟踪 SM.2.7 变更控制 SM.2.6 软件升级 SM.2.5 用户支持 SM.2.1 逻辑文件结构 SM.1.2 维护目录 SM.1.1 维护登录 5.4 行业部门的 LIMS 建模 实验室信息管理系统的基本工作流程包括:样品登录,测试安排,录入结果,审核,批准和报告。 不同行业的实验室可能需要额外的功能以满足特殊的工作流程要求。例如,一个环境实验室可能需要追 踪样品历史延续,处理并对照同批次的样品,集成仪器以处理报告组件以及多层次的审核。此外,还可 能是一些特殊报告的要求。表3列出了一些额外功能,用来满足某些行业部门实验室的特殊要求。
18、图示 功能将覆盖上述实验室基本的工作流。 表3 LIMS 运用单位 样本管理 实验室核 心工作流 程 检查、验 证 系统的集成 报告 扩展功能 重工业 样 品的自动化 安排/有关测 试物品的管理 与进程控制/设 备系统的集成 图表和控制 范围 加入预防性维 修 食物和饮料 从 土壤到餐桌 的样本描述 多级验证 和检查 生产执行系统 的集成、企业资 源计划的集成、 购买力的集成 对过程可变 性的跟踪 有关销售和市 场的异常报告 DB37/T 1797-2010 7 表3 LIMS 运用单位( 续 ) 生命科学 智 控物质的稳 定样本 装量差异 废除计算 产品规范 多级验证 和检查 企业资源计划
19、的集成 异常和发布 对于要求的设 备策略和检定 状态进行验证 公共部门 样本链 监管链 证据链 批处理包 括样本 产品定位的集 成 电子报告结 果 环境 测试用品的分 发/跟踪 产品定位的集 成、设备的集成 普通实验室 保管链 批处理包 括样品 电子报告结 果 6 LIMS 的工作流程和采样周期 6.1 LIMS 工作流程介绍 实验室信息管理系统的工作流程模型提供了基本实验室工作流程,如图2。工作流程图的目的是阐 明实验室信息管理系统的功能与基本实验室工作工序(样本处理、分析和报告)的相互作用。不同的实 验室的特定需求存在非常大的差异。样本的定义、组成和采集因个体实验室而异,并且在不同行业有明
20、 显差异。各自实验室工作流程和样品定义应被定义为实验室信息管理系统生命周期的一部分。图2说明 了实验室信息管理系统的基本功能与工作流程的相互作用。6.3括号内的数字参考了图2具体的工作流 程,反过来又与第五部分中的实验室信息管理系统的建模(图1、表1-表3)相呼应。为了尽可能给出在 每一个工作流模型功能中执行的典型例子,各个层次的实验室信息管理系统建模的项目都被使用。6.3 中的描述不包括每一个建模的功能,并且不局限于某个特定层次。 6.2 LIMS 的基本工作流程 图2描述了实验室信息管理系统进程与相应的实物样品集成时产生的全部逻辑数据流,图中的每个 工作流有唯一的编号。 6.3 LIMS
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