1、ICS 11.220 B 41 DB35 福 建 省 地 方 标 准 DB35/T 18722019 鸭3型腺病毒病诊断技术 Diagnostic technique for duck adenovirus 3 infection 2019 - 12 - 19发布 2020 - 03 - 19实施 福建省市场监督管理局 发 布 DB35/T 18722019 I 目 次 前言.II 1 范围.1 2 缩略语.1 3 疫病概述.1 4 临床诊断.1 5 PCR诊断.1 6 结果判定.3 附录A(规范性附录) 试剂的配制.4 附录B(资料性附录) PCR检测结果电泳图.6 附录C(资料性附录) 参
2、考序列.7 DB35/T 18722019 II 前 言 本标准按照GB/T 1.12009给出的规则起草。 本标准由福建省农业科学院提出。 本标准由福建省农业农村厅归口。 本标准起草单位:福建省农业科学院畜牧兽医研究所、福建省动物疫病预防控制中心。 本标准主要起草人:万春和、黄瑜、傅光华、李中华、程龙飞、刘荣昌、施少华、陈翠腾、陈红梅、 傅秋玲、陈珍、朱春华。 DB35/T 18722019 1 鸭 3 型腺病毒病诊断技术 1 范围 本标准规定了鸭3型腺病毒病的临床诊断、PCR诊断和结果判定。 本标准适用于鸭3型腺病毒病的临床诊断、实验室诊断和流行病学调查。 2 缩略语 下列缩略语适用于本文
3、件。 DAdV-3:鸭3型腺病毒(Duck Adenovirus 3) PCR:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction) PBS:磷酸盐缓冲液(Phosphate Buffer Saline) Tris:三羟甲基氨基甲烷(Trihydroxymethyl Aminomethane) 3 疫病概述 根据国际病毒分类委员会(The International Committee on Taxonomy of Viruses)的最新分类: 腺病毒科(Adenoviridae)下设5个属,分别为富AT腺病毒属(Atadenovirus)、禽腺病毒属 (Aviadenovir
4、us)、鱼腺病毒属(Ichtadenovirus)、哺乳动物腺病毒属(Mastadenovirus)和唾液 酸酶腺病毒属(Siadenovirus)。 鸭3型腺病毒病主要发生于40日龄内雏番鸭,临床表现为肝脏肿大、出血,脾脏肿大,胆囊肿大, 肾脏肿大、出血。流行病学调查表明,该病发病率20%50%,病死率60%70%。 4 临床诊断 4.1 剖检病变 当鸭出现以下肉眼可见病变时,可作为初步诊断的依据之一: a) 肝脏肿大,表面呈点状或斑状出血; b) 脾脏肿大; c) 胆囊肿大; d) 肾脏肿大,表面出血。 4.2 初步诊断 当鸭出现4.1中剖检病变之一时,可做出初步诊断;确诊需进行实验室诊断
5、。 5 PCR诊断 5.1 主要仪器设备 主要仪器设备如下: DB35/T 18722019 2 a) PCR仪; b) 高速台式冷冻离心机; c) 微量移液器; d) 组织匀浆器; e) 电泳仪; f) 电泳槽; g) 紫外凝胶成像系统。 5.2 试剂 主要试剂如下: a) 10%十二烷基硫酸钠(配置方法按照附录A中A.1的规定); b) 蛋白酶K(10 mg/mL)(配置方法按照附录A中A.2的规定); c) 异丙醇; d) Tris饱和酚; e) 酚-三氯甲烷-异戊醇(25:24:1); f) 乙酸钠(3 mol/L,pH5.4); g) 无水乙醇; h) 75%乙醇(配置方法按照附录A
6、中A.3的规定); i) 核糖核酸酶(20 mg/mL); j) 灭菌双蒸水; k) PBS(0.01 M)(配置方法按照附录A中A.4的规定)。 5.3 引物 根据DAdV-3的Fiber 2基因设计特异性引物,序列如下: 上游引物DAdV-3F:5-ACACTAGACAACGGAGGCCT-3。 下游引物DAdV-3R:5-AATCTTGATACGTAATCATACACA-3。 预期目的片段大小为548 bp。 5.4 核酸DNA 提取 5.4.1 酚氯仿法提取核酸DNA 5.4.1.1 取2 g组织(肝脏、脾脏、肾脏或三者混合物),加入6 mL PBS(0.01M)进行研磨处理, 反复冻
7、融3次,4 000 r/min离心15 min,小心吸取上层水相作为组织匀浆液。 5.4.1.2 取420 L组织匀浆液和30 L核糖核酸酶加入1.5 mL灭菌离心管混匀后,室温作用20 min。 5.4.1.3 加入40 L 10%的十二烷基磺酸钠溶液和10 L蛋白酶K溶液,56 水浴2 h。 5.4.1.4 加入等量的Tris饱和酚,颠倒充分混匀,12 000 r/min离心5 min,小心吸取上层水相于 另一1.5 mL灭菌离心管中。 5.4.1.5 加入等量的酚-三氯甲烷-异戊醇(25:24:1),颠倒充分混匀,12 000 r/min离心5 min,小 心吸取上层水相于另一1.5 m
8、L灭菌离心管中。 5.4.1.6 加入1/10体积的乙酸钠和2倍体积冰冻预冷的无水乙醇混匀后,-20 放置1 h。12 000 r/min 离心15 min,去上清。加入600 L 冰冻预冷的75%乙醇清洗2次,倒置于吸水纸上5 min,室温晾干。 加入20 L灭菌双蒸水溶解沉淀,-20 放置备用。 DB35/T 18722019 3 5.4.2 试剂盒法提取核酸DNA 可采用市售商品化的等效核酸DNA提取试剂盒,按照说明书完成核酸DNA提取。 5.5 对照 以纯化的DAdV-3基因组DNA为阳性对照;以灭活的其他鸭源病毒基因组DNA为阴性对照;以灭菌双蒸 水为空白对照。 5.6 PCR扩增
9、5.6.1 PCR反应体系为50 L,每个反应管的反应液配置为:依次加入5 L 10PCR缓冲液,1 L 上/下游引物(引物浓度均为20 M)、4 L dNTP Mixture(各2.5 mM)、2 L提取的基因组DNA、 36.5 L灭菌双蒸水、0.5 L Taq聚合酶。2 000 r/min离心15 s。将上述反应混合液按照以下步骤 进行PCR扩增,94 预变性5 min;循环参数为94 变性50 s,55 退火30 s,72 延伸35 s, 循环35次;第三步72 再延伸10 min结束。 5.6.2 也可采用市售商品化的等效PCR预混液检测试剂盒,并按照市售商品化的试剂盒推荐的条件进
10、行。 5.7 PCR产物电泳 PCR扩增反应结束后,PCR反应管在电泳鉴定前可置于2 8 冰箱保存。分别取5 L PCR扩增 产物与0.5 L 10加样缓冲液(配置方法按照附录A中A.5的规定)混合,然后加入到1.0%琼脂糖凝胶 (配置方法按照附录A中A.6的规定)板的加样孔中,加上DNA分子量标准5 L,以5 V/cm的电压进行 电泳,30 min后在紫外凝胶成像系统观察结果。 6 结果判定 6.1 实验成立的条件 当阳性对照出现约548 bp的特异性条带(参见附录B图B.1中1号泳道)、阴性对照无扩增条带(参 见附录B图B.1中2号泳道),空白对照无扩增条带(参见附录B图B.1中3号泳道)
11、,实验结果成立。 6.2 实验结果判定 当待检样品出现约548 bp条带(参见附录B图B.1中4号泳道),可判定为阳性;当待检样品无特异 性扩增条带(参见附录B图B.1中5号泳道)判为阴性。必要时,将目的条带进行胶回收后克隆测序,待 测样品的测序结果和参考序列(参见附录C)进行核苷酸同源性比较,同源性在98.0%以上判为阳性。 DB35/T 18722019 4 A A 附 录 A (规范性附录) 试剂的配制 A.1 10%十二烷基硫酸钠 将10 g十二烷基硫酸钠溶于80 mL灭菌双蒸水中,调节溶液的pH值至7.2,定容至100 mL,室温保存 备用。 A.2 蛋白酶K(10 mg/mL) 将
12、蛋白酶K(20 mg/mL)和灭菌水按照体积比1:1配置,使用前现用现配。 A.3 75%乙醇 取无水乙醇750 mL加入灭菌双蒸水250 mL,定容至1 000 mL,-20 保存备用。 A.4 PBS(0.01 M) NaCl 8.0 g KCl 0.2 g Na2HPO412H2O 2.9 g KH2PO4 0.2 g 将上述试剂溶于800 mL灭菌双蒸水中,定容至1 000 mL,1.03410 5 Pa高压灭菌30 min,4 保 存备用。 A.5 10加样缓冲液 聚蔗糖 25 g 溴酚蓝 0.1 g 二甲苯青 0.1 g 灭菌双蒸水 定容至100 mL A.6 1.0%琼脂糖凝胶
13、琼脂糖 1.0 g 1TAE电泳缓冲液(配制方法按照A.7的规定) 定容至100 mL 置微波炉中加热至完全融化,待冷至50 60 时,加溴化乙锭溶液(配制方法按照A.8的规 定)5 L,摇匀后倒入制胶板中,待完全凝固后取下加样梳,备用。 DB35/T 18722019 5 A.7 1TAE电泳缓冲液 50TAE电泳缓冲液(配制方法按照A.9的规定) 20 mL 灭菌双蒸水 定容至1 000 mL。 A.8 溴化乙锭溶液 溴化乙锭 20 mg 灭菌双蒸水 定容至20 mL 说明:也可采用市售商品化的更环保、更安全Goldviewer等荧光染料。 A.9 50TAE电泳缓冲液 Tris 242
14、g 冰乙酸 57.1 mL 0.5 mol/L乙二铵四乙酸二钠溶液(pH8.0) 100 mL 灭菌双蒸水 定容至1 000 mL 用时用灭菌双蒸水稀释50倍使用。 DB35/T 18722019 6 B B 附 录 B (资料性附录) PCR检测结果电泳图 PCR检测结果电泳图如图B.1所示。 说明: M DNA分子量标准; 1 阳性对照(鸭3型腺病毒); 2 阴性对照(灭活的其他鸭源病毒); 3 空白对照; 4 待检样品(鸭3型腺病毒阳性); 5 待检样品(阴性)。 图B.1 PCR检测结果电泳图 M 1 2 3 4 5 bp 2000 1000 750 500 250 100 bp 54
15、8 DB35/T 18722019 7 C C 附 录 C (资料性附录) 参考序列 鸭3型腺病毒参考序列: ACACTAGACAACGGAGGCCTCGACCTCAAGGTGGACCCAGGAAGCCTGGCCGTCACTGACAATACCCTACACCTCACAAGCTCAT ACTCAACCTATGTCTTTACGAGTGGATCTGACACACTTCAGAAGACACAAGCCCAAGTGTGCTGCGGAGCAGGGTCTGTTACGTTTCCG TGCGCATACTATGCCAAGATCGTATGCTCAAACAATGTGTCTTCAGGATATATAACACTGAAGGTGAGC
16、GCTGAGGATGCATCACATGC TGTAGATCAACGCTTCGCGACTATTCAACCAGTATTCACATTCTGGTTATGTCGAGACATAGGTAATGAAAACACCGTCAATTTTTCCC ACTGTACCAACAACAGTTATAAGCCAGAGGAAACCGCAGTCGTTAAGGCATGCATCACACCAGCATACAAAAATTTTGATGTCAGCAAT GTTTCAGAACATGACTTTATTCTGTATAACTATAGTGGGGTAAACACATCAGGAGTTCCAATAGGCACAGGGAACCTAAAGAATGTGTA TGATTACGTATCAAGATT _ DB35/T18722019 福建省地方标准鸭3型腺病毒病诊断技术DB35/T 18722019*2019年12月第一版2019年12月第一次印刷