1、ICS 65.020.30 CCS B 44 DB11 北京市地方标准 DB11/T 18042020 代替DB11/T 828.32011,DB11/T 1053.32013,DB11/T 1461.12017,DB11/T 1461.22017, DB11/T 1461.32017,DB11/T 1461.42018,DB11/T 1461.52018 实验动物 繁育与遗传监测 Laboratory animalBreeding and genetic monitoring 2020 - 12 - 24发布 2021 - 04 - 01实施 北京市市场监督管理局 发布 DB11/T 180
2、42020 I 目 次 前言. II 1 范围 . 1 2 规范性引用文件 . 1 3 术语和定义 . 1 4 缩略语 . 2 5 遗传分类及命名原则 . 2 6 繁殖方法 . 4 7 遗传监测 . 5 附录A(规范性) 实验动物微卫星DNA标记遗传检测方法 . 8 附录B(规范性) 实验斑马鱼SNP遗传标记的检测方法 . 26 附录C(规范性) MHC单倍型实验鸡和实验鸭直接测序检测方法 . 29 参考文献 . 34 DB11/T 18042020 II 前 言 本文件按照GB/T 1.12020标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则的规定起 草。 本文件替代DB11/T 82
3、8.32011实验用小型猪 第3部分:遗传质量控制、DB11/T 1053.32013 实验用鱼 第3部分:遗传质量控制、DB11/T 1461.12017实验动物 遗传质量控制 第1部分: 实验用猪、DB11/T 1461.22017实验动物 遗传质量控制 第2部分:实验用牛、DB11/T 1461.3 2017实验动物 遗传质量控制 第3部分:实验用羊、DB11/T 1461.42018实验动物 繁育与 遗传监测 第4部分:实验用狨猴、DB11/T 1461.52018实验动物 繁育与遗传监测 第5部分:实 验用长爪沙鼠,除结构调整和编辑性改动外,主要技术变化如下: a) 删除了“实验鱼命
4、名原则”相关内容(见DB11/T 1053.32013的4.2); b) 增加了“实验雪貂、实验猫、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鸽繁育与遗传监测”相关内容(见 5、6、7、附录A、附录C)。 本文件由北京市科学技术委员会提出并归口。 本文件由北京市科学技术委员会组织实施。 本文件起草单位:首都医科大学、中国食品药品检定研究院、北京市实验动物管理办公室、中国医 学科学院医学实验动物研究所、 中国人民解放军军事医学研究院、国家卫生健康委员会科学技术研究 所、杭州医学院、吉林大学、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、 北京市标准化研究院、北京华阜康生物科技股份有限公司、
5、北京康蓝生物技术有限公司、中国科学院水 生生物研究所、北京大学。 本文件主要起草人:陈振文,李根平,贺争鸣,李长龙,刘云波,孙德明,岳秉飞,李奎,杨述林, 冯书堂,杜小燕,向志光,王洪,董罡,任文陟,陈洪岩,陈继兰,巩薇,冯育芳,郭红刚,王锡乐, 刘文菊,樊子风,萨晓婴,刘先菊,丛日旭,腾永康,肖冲,魏杰,于鹏丽, 牟玉莲,公维华,张宁波, 徐玲玲,崔宗斌,张博,孙荣泽,韩凌霞。 本文件及其所代替文件的历次版本发布情况为: 首次发布分别为DB11/T 828.32011、DB11/T 1053.32013、DB11/T 1461.12017、DB11/T 1461.22017、DB11/T 1
6、461.32017、DB11/T 1461.42018、DB11/T 1461.52018; 本次为第一次修订。 DB11/T 18042020 1 实验动物 繁育与遗传监测 1 范围 本文件规定了实验动物的遗传分类及命名原则、繁殖方法和遗传检测。 本文件适用于实验小型猪、实验猪、实验牛、实验羊、实验狨猴、实验长爪沙鼠、实验猫、实验雪 貂、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鸽、实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)的繁育和遗传监测。 2 规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件, 仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有
7、的修改单)适用于本 文件。 GB/T 2416 东北细毛羊 GB/T 3157 中国荷斯坦牛 GB 14923 实验动物 哺乳类实验动物的遗传质量控制 GB/T 19166 中国西门塔尔牛 GB/T 19376 波尔山羊种羊 GB/T 22283 长白猪种猪 GB/T 22284 大约克夏猪种猪 GB/T 22285 杜洛克猪种猪 GB/T 22909 小尾寒羊 GB/Z 34792 实验动物 引种技术规程 NY/T 14 高产奶牛饲养管理规范 NY 625 迪卡配套系猪种猪 NY/T 1339 肉牛育肥良好管理规范 NY/T 1446 种公牛饲养管理技术规程 NY/T 1673 畜禽微卫星D
8、NA遗传多样性检测技术规程 NY/T 1901 鸡遗传资源保种场保种技术规范 NY/T 2662 标准化养殖场 奶牛 NY/T 2665 标准化养殖场 肉羊 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 实验动物 laboratory animal 经人工饲育,对其携带的微生物和寄生虫实行控制,遗传背景明确或者来源清楚,用于科学研究、 DB11/T 18042020 2 教学、生产和检定以及其他科学实验的动物。 来源:GB 14925-2010,3.1 3.2 实验种群 experimental population 以远交方式进行繁殖生产的实验动物群体。 3.3 封闭群 closed
9、 colony 以非近亲交配方式进行繁殖生产,在不从外部引入新个体的条件下,至少连续繁殖4代以上的实验 动物种群。 3.4 近交系 inbred strain 通过近亲交配的繁殖方式培育,近交系数(inbreeding coefficient)高于99%的实验动物群体。 3.5 单倍型群体 haplotype population 通过近亲交配繁殖方式培育出的单倍体基因型一致的实验动物群体。 3.6 杂交群 hybrids 由两个不同近交系杂交产生的后代群体。 注:子一代简称F1。 4 缩略语 下列缩略语适用于本文件。 PCR:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction
10、) SNP: 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism) STR: 短串联重复序列(Short Tandem Repeat) 5 遗传分类及命名原则 5.1 遗传分类 根据不同品种品系动物及个体间遗传差异将实验动物分为实验种群、封闭群、近交系、单倍型群体 和杂交群,具体符合表1的要求。 表1 实验动物遗传分类表 实验动物群体 遗传分类 实验长白猪 实验种群 实验大约克夏猪 DB11/T 18042020 3 表1 实验动物遗传分类表(续) 实验动物群体 遗传分类 实验杜洛克猪 实验种群 实验中国荷斯坦牛 实验西门塔尔牛 实验波尔山羊 实验小尾寒羊 实验东北细
11、毛羊 实验狨猴 实验猫 实验雪貂 实验长爪沙鼠 封闭群 实验鸡 实验鸭 实验鹅 实验鸽 实验小型猪 实验斑马鱼 实验剑尾鱼 实验小型猪 近交系 实验斑马鱼 实验剑尾鱼 实验鸡 单倍型群体 实验鸭 5.2 命名原则 5.2.1 实验种群 在原有的品种品系名称前面加上实验,如实验长白猪。 5.2.2 封闭群 由24个大写英文字母命名。种群名称前标明保持者的英文缩写名称,第一个字母大写,后面的字 母小写,宜不超过4个字母。保持者与种群名称之间用冒号分开。 5.2.3 近交系 以大写英文字母或大写英文字母加阿拉伯数字命名,符号应简短。 5.2.4 单倍型群体 以单倍体基因型英文名称(或缩写)加英文字母
12、和阿拉伯数字命名,符号应简短。 5.2.5 杂交群 DB11/T 18042020 4 以雌性亲代名称在前,雄性亲代名称在后,二者之间以符号“”相连。将以上部分用括号括起,在 其后表明杂交代数,以F1Fn表示。 6 繁殖方法 6.1 实验种群 6.1.1 引种 选择双亲健康、无遗传疾病、繁殖性能好、体貌符合品种特征的动物作为种用动物。 6.1.2 繁育方法 实验猪按照NY 625的规定进行。 实验西门塔尔牛按照NY/T 1339和NY/T 1446规定执行,实验中国荷斯坦牛按照NY/T 14和NY/T 2662 的规定进行。 实验羊应按照GB 14923和NY/T 2665的规定进行。 实验狨
13、猴和雪貂应按GB 14923的规定进行。 实验猫按照雌雄5:1以上比例进行繁殖。 6.2 封闭群 6.2.1 引种 作为繁殖用种子的封闭群动物应三代以内无共同亲代并符合GB/Z 34792对封闭群种用动物的要求。 封闭群实验长爪沙鼠和实验鸽引种数量不少于25对。 封闭群实验小型猪引种数量不少于13对(循环交配方式繁殖)或25对(随机交配方式繁殖)。 封闭群实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)引种数目不少于100尾。 实验鸡、实验鸭和实验鹅引种规模按照NY/T 1901执行。 其他封闭群实验动物引种规模按照GB 14923规定执行。 6.2.2 繁育方法 封闭群实验小型猪、实验长爪沙鼠和实验鸽繁殖方法按照G
14、B 14923的规定执行。 实验鸡、实验鸭、实验鹅应按照NY/T 1901的规定进行。 6.3 近交系 6.3.1 引种 作为繁殖用种子的近交系动物应符合GB/Z 34792对近交系种用动物的要求。 6.3.2 繁育方法 近交系实验动物可分为基础群(foundation stock)、血缘扩大群(pedigree expansion stock) 和生产群(production stock),当近交系动物生产供应数量不是很大时,可不设血缘扩大群,仅设基 础群和生产群。各基础群、血缘扩大群和生产群的繁育方式按照GB 14923执行。 6.4 单倍型群体 6.4.1 引种 DB11/T 18042
15、020 5 作为繁殖用种子的单倍型群体动物按照GB/Z 34792的规定执行。 6.4.2 繁育方法 以全同胞或半同胞兄妹交配方式进行。 6.5 杂交群 将不同品系实验动物的亲代雌性与亲代雄性杂交,即可得到F1实验动物。 7 遗传监测 7.1 遗传要求 遗传满足以下要求: 体貌符合品种特征; 谱系记录清楚; 繁殖方法科学; 群体遗传符合品种特征; 遗传质量检测合格。 7.2 遗传检测 7.2.1 检测频率 每12个月至少进行一次检测。 7.2.2 抽样 7.2.2.1 实验种群和封闭群抽样数量 从每个种群中随机抽取非同窝成年实验动物的血液或其他组织,雌雄各半。抽样数量按照表2规定 执行。 表2
16、 实验种群和封闭群遗传检测抽样数量 群体大小(只/头/羽) 抽样数量(只/头/羽) 100 15 100 30 7.2.2.2 近交系实验动物抽样数量 基础群留种动物的双亲均应进行遗传检测;各生产群体采取随机抽取非同窝成年动物雌雄各半,抽 样数量按照表3规定执行。 表3 近交系实验动物遗传检测抽样数量 群体大小(只/头/羽/尾) 抽样数量(只/头/羽/尾) 100 6 100 群体数量6% DB11/T 18042020 6 7.2.3 遗传检测方法 采用群体遗传结构评估、微卫星DNA标记、SNP分子标记和直接测序等检测方法,在有检测能力的实 验室进行,具体按照表4规定执行。 表4 遗传检测方
17、法适用实验动物群体 实验动物群体 遗传分类 检测方法 执行标准或方法 实验长白猪 实验种群 群体遗传结构评估 按照GB 22283的规定执行 实验大约克夏猪 按照GB 22284的规定执行 实验杜洛克猪 按照GB 22285的规定执行 实验中国荷斯坦牛 按照GB/T 3157的规定执行 实验西门塔尔牛 按照GB 19166的规定执行 实验波尔山羊 按照GB 19376的规定执行 实验小尾寒羊 按照GB/T 22909的规定执行 实验东北细毛羊 按照GB/T 2416的规定执行 实验狨猴 微卫星DNA标记检测法 按照附录A的规定执行 实验猫 实验雪貂 实验长爪沙鼠 封闭群 实验鸡 实验鸭 实验鹅
18、 实验鸽 实验小型猪 实验斑马鱼 实验剑尾鱼 实验小型猪 近交系 实验斑马鱼 SNP分子标记检测法 按照附录B的规定执行 实验剑尾鱼 实验鸡 单倍型群体 直接测序检测法 按照附录C的规定执行 实验鸭 7.2.4 结果判定 7.2.4.1 实验种群检测结果判定 7.2.4.1.1 群体遗传结构评估 当实验猪、实验牛、实验羊体貌特征与品种品系特征相符合时,判定合格,否则判定不合格。 7.2.4.1.2 微卫星DNA标记检测法 实验狨猴、实验猫和实验雪貂适用于微卫星DNA标记检测法。 DB11/T 18042020 7 实验狨猴和实验猫采用群体平衡状态方法进行评价。按照哈代-温伯格(Hardy-We
19、iberg)定律,根 据各位点的等位基因数计算封闭群的基因频率,进行卡方(chi-square test)检验。当群体达到平衡 状态,该群体判为合格,否则判为不合格。 实验雪貂采用群体平均杂合度进行评价,当群体平均杂合度在0.50.7时,该群体判为合格,否则 判为不合格。 7.2.4.2 封闭群实验检测结果判定 封闭群实验长爪沙鼠、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鹅、实验小型猪和实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼) 采用微卫星DNA标记检测法。 封闭群采用平均杂合度进行评价,当群体平均杂合度在0.50.7时,该群体判为合格,否则判为不 合格。 7.2.4.3 单倍型群体检测结果判定 单倍型实验鸡和实验鸭采用聚
20、合酶链式反应(PCR)产物直接测序法。 单倍型采用单倍基因型序列进行评价,当测定序列与参考序列一致率为100%时,该群体判为合格, 否则判为不合格。 7.2.4.4 近交系检测结果判定 7.2.4.4.1 微卫星DNA标记检测法 近交系实验小型猪采用微卫星DNA标记检测法。 近交系实验小型猪采用微卫星DNA品系特征进行评价,当检测位点符合品系的特征时,该群体判为 合格,否则判为不合格。 7.2.4.4.2 SNP分子标记检测法 近交系实验鱼采用SNP分子标记检测法。 近交系实验鱼采用SNP分子标记位点特征进行评价,当检测位点符合品系的特征时,该群体判为合 格;当一个位点与参考位点不一致时,判为
21、可疑,增加检测位点数量和增加检测方法重新检测;当有两 个及以上位点与参考位点不一致时,判为不合格。 DB11/T 18042020 8 附 录 A (规范性) 实验动物微卫星DNA标记遗传检测方法 A.1 基因组DNA的提取 基因组DNA提取方法按照NY/T 1673的规定执行。 A.2 微卫星位点 A.2.1 用于检测封闭群和近交系实验小型猪遗传质量的微卫星位点分别为25个和10个,各微卫星位点 的名称、染色体位置、引物序列、等位基因数、等位基因范围和退火温度按照表A.1的规定执行。 表A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 位点 引物序列(53) 所
22、在染色体 Mg 2+浓度 (mM) 退火温度 () 等位基 因数 等位基因 范围 适用群体 SW974 GGTGAAGTTTTTGCTTTGAACC GAAAGAAATCCAAATCCAAACC 1 2.0 58 17 129175 封闭群 S0091 TCTACTCCAGGAGATAAGCCAGAT CAGTGACTCCATGCACAGTTATGA 2 1.5 55 14 96174 封闭群 SW240 AGAAATTAGTGCCTCAAATTGG AAACCATTAAGTCCCTAGCAAA 2 1.5 58 11 92114 封闭群 SW1066 GCAGGATGAACCACCCTG C
23、TCTTGAGGCAACCTGCTG 3 2.0 60 19 166214 封闭群 SW1089 TTTTCCCCTTCACTCACCC GATCAAAGTCCCTTACTCCGG 4 1.5 58 10 142190 封闭群 S0005 TCCTTCCCTCCTGGTAACTA GCACTTCCTGATTCTGGGTA 5 2.0 54 11 204244 封闭群 SW1057 TCCCCTGTTGTACAGATTGATG TCCAATTCCAAGTTCCACTAGC 6 2.0 58 14 142191 封闭群 SW632 TGGGTTGAAAGATTTCCCAA GGAGTCAGTACT
24、TTGGCA 7 2.0 54 9 148173 封闭群 OPN CCAATCCTATTCACGAAAAAGC CAACCCACTTGCTCCCAC 8 2.0 59 12 138170 封闭群 SW29 AGGGTGGCTAAAAAAGAAAAGG ATCAAATCCTTACCTCTGCAGC 8 2.0 61 12 133187 封闭群 SW911 CTCAGTTCTTTGGGACTGAACC CATCTGTGGAAAAAAAAAGCC 9 2.0 60 14 151178 封闭群 DB11/T 18042020 9 表A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因
25、分布范围(续) 位点 引物序列(53) 所在染色体 Mg2+浓度(mM) 退火温度 () 等位基因数 等位基因范围 适用群体 SW511 AAGCAGGAATCCCTGCATC CCCAGCCACCAGTCTGAC 9 1.5 62 12 161196 封闭群 SWr158 TCCAATTCAACTCCTGGCTC GAATGTGCACATACCACATGC 10 2.0 60 18 158200 封闭群 SW951 TTTCACAACTCTGGCACCAG GATCGTGCCCAAATGGAC 10 1.5 58 14 108142 封闭群 SW271 TTCCAGTGGCTTTCTGTGC
26、 CATTCATTCCCAGTGAAACTTG 11 1.5 58 13 111144 封闭群 S0386 TCCTGGGTCTTATTTTCTA TTTTTATCTCCAACAGTAT 11 2.0 48 12 155178 封闭群 S0068 CCTTCAACCTTTGAGCAAGAAC AGTGGTCTCTCTCCCTCTTGCT 13 2.0 62 10 210256 封闭群 SWr1008 ACAGCCACCAACAGTGTTTG GAACTTCCATATGCTGCAAGTG 13 2.0 62 16 98256 封闭群 S0007 TTACTTCTTGGATCATGTC GTCCC
27、TCCTCATAATTTCTG 14 2.0 54 15 142192 封闭群 SW857 TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC GATCCTCCTCCAAATCCCAT 14 2.0 58 16 129173 封闭群 SWr312 ATCCGTGCGTGTGTGCAT CTGGTGGCTACAGTTCCGAT 15 1.5 64 11 116136 封闭群 SW81 gatctggtcctgcacaggg GGGGCTCTCAGGAAGGAG 16 1.5 60 8 128144 封闭群 SWr1120 CAAATGGAACCCATTACAGTCC ACTCCTAGCCCAGGAG
28、CTTC 17 1.5 60 11 147178 封闭群 S0062 AAGATCATTTAGTCAAGGTCACAG TCTGATAGGGAACATAGGATAAAT 18 2.0 56 12 144204 封闭群 S0218 GTGTAGGCTGGCGGTTGT CCCTGAAACCTAAAGCAAAG X 1.5 54 11 158196 封闭群 CGA ATAGACATTATGTAAGTTGCTGAT GAACTTTCACATCCCTAAGGTCGT 1q 2.5 55 12 250320 近交系 SW240 AGAAATTAGTGCCTCAAATTGG AAACCATTAAGTCCC
29、TAGCAAA 2P 1.5 55 8 96115 近交系 SW72 ATCAGAACAGTGCGCCGT GTTTGAAAATGGGGTGTTTCC 3P 1.5 55 8 100116 近交系 S0005 TCCTTCCCTCCTGGTAACTA GCACTTCCTGATTCTGGGTA 5q 3.0 55 10 205248 近交系 S0090 CCAAGACTGCCTTGTAGGTGAATA GCTATCAAGTATTGTACCATTAGG 12q 1.5 55 4 244251 近交系 DB11/T 18042020 10 表A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因
30、数及等位基因分布范围(续) 位点 引物序列(53) 所在染色体 Mg2+浓度(mM) 退火温度 () 等位基因数 等位基因范围 适用群体 SW769 GGTATGACCAAAAGTCCTGGG TCTGCTATGTGGGAAGAATGC 13 3.0 55 7 106140 近交系 SW857 TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC GATCCTCCTCCAAATCCCAT 14 1.5 55 6 144160 近交系 S0355 TCTGGCTCCTACACTCCTTCTTGATG GTTTGGGTGGGTGCTGAAAAATAGGA 15 3.0 55 14 243277 近交系
31、SW24 CTTTGGGTGGAGTGTGTGC ATCCAAATGCTGCAAGCG 17 1.5 55 8 96121 近交系 S0218 GTGTAGGCTGGCGGTTGT CCCTGAACCCTAAAGCAAAG X 1.5 55 8 164184 近交系 A.2.2 用于检测实验狨猴遗传质量的微卫星位点为20个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因 数、等位基因范围和退火温度按照表A.2的规定执行。 表A.2 实验狨猴微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 位点 引物序列(53) 退火温度() 最大等位基因数 等位基因分布范围 CAJA1 GAAGACGGG
32、GGCGTAAATA TGTGGTGGCTCATACCTGAA 60 9 386402 CAJA6 GAGCACCAAGATTGGCATTT CCAATACACATCGGCTTTGA 60 6 235243 CAJA10 ACCCTACATTGCCAAATTGC GCCTCTTCTGAGGGAAGTGA 60 6 198208 CAJA11 CGAAAGTGTGCTCAACAGGA AAGGTGGGATTCTGAAAGCA 60 5 254262 CAJA13 AGCACATGAACACCCAGGTT AGTGAAAACAGGCTGGGAGA 60 6 378390 CAJA14 AGCACA
33、TGAACACCCAGGTT AGTGAAAACAGGCTGGGAGA 60 6 216232 CAJA17 GGGCACTCCAAGGTCAGTAA TTGCCCCCTGCTTATTGTAG 60 10 382400 CAJA18 ACTTGCAGGCCAGTGTTCTT TGGACAGCTGAGGTTTCCTT 63 8 315329 D10qham51 CGGGAATTCAAAGGCGTTCT AGGAGGATTTCGCATTTGGG 60 6 103117 Ham157 CAGCCAACATGCTTCTCAGT GGTGGAATAAATCAGGCTACCAG 60 6 193205 H
34、am60 TGCTCTAGAGGTTCCACTCTG GGCATGTTACCTAACCTCTCTG 58 8 139165 DB11/T 18042020 11 表A.2 实验狨猴微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) 位点 引物序列(53) 退火温度() 最大等位基因数 等位基因分布范围 Ham65 TGAGAACGACTGCTCTAGGT TGGAAGTGGCTTCATTCCTG 58 10 177201 Ham181 CAATGAGATGTGTCCAAGTGAG CCAAACACCCAATATGCAGT 58 7 213239 Ham184 GGCGCAGCT
35、CATCTCTTCAC CCTCCCCAGCATCTTCAAGAC 63 7 150172 Ham125 GTGGGTAAATGCTGCCATCT GTTTCAACTCCTGCGTCTAGTC 59 8 187201 Ham101 AGACCAAGCATCTTCTTGGAC CACCTTTAAACTGCTGTGGTTG 59 6 281297 Ham61 CAAAGATGCTTGGGGATGGA AAGATCTTGCAGGGCGTAAG 61 10 263287 Ham32 GCCCAAATCCTGTTTGACAC CCACCTAGATCATCGAGAGTAG 58 7 183199 Ham1
36、00 GACCAACTCCAAAGCTAGCA GGTAACATGCTCTCGACCTT 58 8 244262 Ham26 GCAAATTCGTGAAGCATTCC AACAGTTGGATGAGTTCCAG 59 8 182206 A.2.3 用于检测实验长爪沙鼠遗传质量的微卫星位点为28个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位 基因数、等位基因范围和退火温度按照表A.3的规定执行。 表A.3 实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 位点 引物序列(53) 退火温度() 最大等位基因数 等位基因分布范围 AF200942 CAGGCACCCCCAGTTT GT
37、CTACACAGGCTGAGGATGT 54 15 180215 AF200943 GGCTCCTGATTCTACATTTCT CAACCATTGGCAACTCTC 57 17 154181 AF200944 GCTGGGCTTTAATGTTTATTT GGTGGCTCACACTTTCTGT 54 19 113134 AF200946 TTTCTGGGGTCTCTTTCTCTC CCATTCTGCAAGACTCCTCT 57 28 195242 AF200945 AGTCCCTATTACATCCACAAG TTATCCTGCAAAGCCTAAG 57 12 166186 AF200941 TG
38、GGTCCTTTGGAAGA TGGCTTAAAATGAATCACTTA 55 24 115153 AF200947 GACAGAGTGGGAGGGGTATGT TGGCAAGTTTGGTTTGTTTGA 55 17 188212 DB11/T 18042020 12 表A.3 实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) 位点 引物序列(53) 退火温度() 最大等位基因数 等位基因分布范围 D16Mit7 CTGCCACCCCTGAACCATTA CTACAAGATGTGGGGCATGA 52.6 15 480529 D16Mit26 CAGGAATAAA
39、GTATAATGGGGTGC CCCATGATCAGTTGGGTTTT 49.1 9 207266 D1Mit362 TGTGTGACTGCTTGGAAGATG CTGAGTCCCTAAAGTTGTCCTTG 50.0 16 476504 D8Mit184 GTTTTTCTCAGAAGAATGCAATATACC TGAGAAGAATGAGGAATTTGTCC 48.1 11 196229 D7Mit33 TCTGAAGTTTGAATGGTTGTGG TTTCAAAATCGTGTCATTTTGC 47.3 15 376394 D6Mit37 AAAGAATTGCACATCCACTGG TGCCC
40、AGGATGTTTAAGAGG 47.0 14 246265 D5Mit31 TCAGGGCTCTCTAAGGGACA ACTATGCAGCCACCAAATCC 53.1 9 318350 D12Mit201 CCACTGGATGGCAACAGAC TATGTGTTTCAAAACCACACTCG 53.1 18 245283 D2Mit22 GCTCCCTTTCCTCTTGAACC GGGCCCTTATTCTATCTCCC 49.1 9 173192 D15Mit124 AGGAGAGAACCAACTGCTGC GGCCAGTGATGACTTTATAATGC 59.8 17 232258 D1
41、1Mit36 CCAGAACTTTTGCTGCTTCC GTGAGCCCTAGGTCCAGTGA 58.7 15 234256 D7Mit71 CCACCTGGAATACATGTAACCC TAAGATCCAAGAGATGGGTTAAGC 49.1 11 165200 D2Mit76 CTCAAGTCTCACTTCTCTGCACA ACACCCAAGGTTGACCTCTG 47.3 19 281328 D3Mit130 AACACATGAAACGTGTGCGT TGATAGGCATGCTTAAGCCC 50.6 11 213251 D19Mit1 AATCCTTGTTCACTCTATCAAGG
42、C CATGAAGAGTCCAGTAGAAACCTC 49.1 15 133165 D11Mit35 AGTAACATGGAACATCGACGG TGCTCAGCTCTGGAGTGCTA 48.1 13 287307 D17Mit38 CCTCTGAGGAGTAACCAAGCC CACAGAGTTCTACCTCCAACCC 52.6 14 195251 DXMit17 CCTGTTTGGGCACCTAGATT TAATAACCCATGTTTTCTGTGGG 48.1 9 234251 D8Mit56 ACACTCAGAGACCATGAGTACACC GAGTTCACTACCCACAAGTCTC
43、C 50.6 9 100126 DB11/T 18042020 13 表A.3 实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) 位点 引物序列(53) 退火温度() 最大等位基因数 等位基因分布范围 D10Mit66 TCTCCTTGGAATTCACAGCC GACATTCCTTAAGAGAGACAGTCC 54.7 14 272298 D13Mit1 TCATTCAACATTCTGTCAATCG CACAACAAGGTTAACCTCTAGACA 49.0 14 104132 A.2.4 用于检测封闭群实验雪貂遗传质量的微卫星位点为21个,各微卫星位点的名称、引
44、物序列、重 复等位基因数按照表A.4的规定执行。 表A.4 实验雪貂微卫星位点的引物序列、等位基因数及等位基因分布范围 位点 引物序列(53) 等位基因分布范围 重复等位基因数 Mpu A4w1 CACTTCCTCCCATGGACACT CAAAGTCTCCCACCCTATGC 152174 (AC)23 Mpu A10w4 TGGCCTATATGTGCAGATGAC TGTTTGTCTTGTACCCTCTGACC 154158 (AC)13(AC)7 Mpu A121w7 ACTGCCATCAGGTCATCTAGG GGGTAGACACCTGGCTCAAG 105129 (CA)14 Mpu
45、 A129w7 GGCCTCTGAACACATAGTTG AAGTACAGAATGGAAGGATCTG 197205 (CA)13 Mpu A212w1 CCCTATGAGGGCATGTTTGT CTGCCATGTTTCCACTGGT 137153 (TG)13 Mpu A223w3 GAAGACAGCACCCCAGAGTC T GGTTGCCAAGAACTAGCAG 213239 (GT)19 Mpu A229w4 GGGTAGGACGTGCTTAAAGATG AGCCCTCAAAGCCTCTTCTC 107139 (GT)11(TG)7 Mpu A231w6 CCTCTGGTAACCATC
46、TGTTTG TCTTCAAGATGTTCAGTGTGGA 182224 (GT)15 Mpu B1w4 TCCACTACCTGGCCTCATTC ACCTCAGGCTCCACTCTCAG 178190 (CT)15(CA)8 (AC)5(AC)11 Mpu B6w2 T GGGTGTAGAGCATGTTTGG TGCCTATTCCAGGTACCTCAT 156164 (TC)18 Mpu B9w7 CGTTACCAACTGTGGCTGTG TGCCTGGGCCTGTGATTA 180192 (GA)18 Mpu B12w3 AGTCGACAGATGAGTCCACGAAG TGTCACACAT
47、GGCAGGATCT 175179 (AG)11(AC)8(AC)7 Mpu B112w5 CCATTACAAGTGCTTGGAGACA TGGAACATGCTGGAAATTGT 161165 (AG) 14 Mpu B202w3 TCTCCTCCTCCTCCTCCTTC ATGAGATTGACCGTGCATCA 164168 (CTC)5(GA)14 DB11/T 18042020 14 表A.4 实验雪貂微卫星位点的引物序列、等位基因数及等位基因分布范围(续) 位点 引物序列(53) 等位基因分布范围 重复等位基因数 Mpu B209w2 TGCTTCTCCCTCTGACTGCT CCGCCCAAGTATCCCTAAAT 119125 (CT)16 Mpu B217w3 TTCCCTGCTTGTGCTCTCTT TGGGGTAAGGGTAGGTATGC 126144 (TC)5(TC