1、 ICS 65.120 B 46 DB50 重 庆 市 地 方 标 准 DB50/T 9532019 饲料中大肠杆菌O157的快速检测 环介导等温扩增(LAMP)法 Rapid determination of Escherichia coli O157 in feeds Loop-mediated isothermal amplification detection method 重庆市市场监督管理局 发布 2019-12-12发布 2020-03-15实施 DB50/T 953-2019 I 前 言 本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。 本标准由重庆市农业农村委员会提出并归
2、口。 本标准起草单位:重庆市动物疫病预防控制中心,重庆市兽药饲料检测所。 本标准主要起草人员:胡健、周莉、侯亚莉、朱英才、盛欣、丁平、何义刚、张毅、王美珍、张军 等。 DB50/T 953-2019 1 饲料中大肠杆菌O157的快速检测方法 环介导等温扩增(LAMP)法 1 范围 本标准规定了用环介导等温扩增(LAMP)法检测饲料中大肠杆菌O157的原理、试剂、仪器和设 备、操作步骤、结果判定和表述。 本标准适用于饲料中大肠杆菌O157的筛选检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本
3、(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB 4789.36 食品安全国家标准 食品微生物学检验 大肠埃希氏菌 O157 :H7/NM检验 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB 19489 实验室 生物安全通用要求 3 生物安全措施 培养物和废弃物处理应按照GB 19489的规定执行。 4 原理 用热裂解法提取大肠杆菌O157的基因组DNA作为环介导等温扩增模板,根据大肠杆菌O157的rfbE 基因特异序列,设计5条LAMP引物(参见附录A),建立LAMP反应体系,恒温反应结束后根据添加的 染料显色情况进行结果判断。 5 试剂 5.1 除另有规定外,试剂为分析纯试剂,试验用水符合
4、GB/T 6682的要求。 5.2 改良EC肉汤(mEC+n)。 5.3 营养肉汤。 5.4 生理盐水。 5.5 双蒸水(ddH2O)。 5.6 合成大肠杆菌O157检测用引物,包括外引物一对,内引物一对,环状下游引物一条。外引物F3: 5-TCTCAATTCTAACTAGGACCGCAGA-3;外引物B3:5-ATAACTTGCTCATTCGATAGGCTGG-3; 内引物FIP:5-ACAGGGTAAAAAACTGGCCTGAGGAATTAAGGAATCACCTTGC-3;内引物BIP: 5-CACGATGCCAATGTACTCGGAAAAATAATTCCACGCCAACCAAGA-3;环
5、状下游引物LB: 5-ATCAAAAGCACCCTATAGCTGAG-3。将各引物用双蒸水溶解,配置成100 mmol/L的储备浓度, 用双蒸水稀释为10 mmol/L工作浓度备用。 5.7 Bst DNA聚合酶。 5.8 脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPS),包括dATP、dTTP、dGTP、dCTP各10 mmol/L。 5.9 MgCl2溶液(50 mmol/L)。 5.10 10Bst DNA聚合酶缓冲液(200 mmol/L Tris-HCl(pH8.8)、100 mmol/L KCl、100 mmol/L (NH4)2SO4、20 mmol/L MgSO4、1% Triton X-10
6、0)。 5.11 甜菜碱,用双蒸水溶解,配置成5 mol/L溶液。 DB50/T 953-2019 2 5.12 钙黄绿素C46H46N2O23,用双蒸水溶解,配置成625mol/L溶液。 5.13 MnCl2,用双蒸水溶解,配置成7.5 mmol/L溶液。 5.14 阳性对照:大肠杆菌O157标准菌株基因组DNA。 6 仪器和设备 6.1 移液器,量程为0.5L10L,10L100L,量程100L1000L。 6.2 无菌均质袋,500mL。 6.3 锥形瓶,500mL。 6.4 水浴锅或恒温金属浴,精度1。 6.5 高速离心机,7000 g。 6.6 恒温培养箱,精度1。 6.7 电子天平
7、:感量0.01g、感量0.0001g。 7 采样 7.1 采样原则 样品的采集应遵循随机性、代表性的原则。采样过程应遵循无菌操作程序,防止一切可能的外来污 染。 7.2 采样方法 7.2.1 应在同一批次产品中采集样品,每件样品的采样量应满足微生物指标检验的要求,一般不少于 500g(mL)。 7.2.2 独立包装不大于500g的固态产品或不大于500mL的液态产品,取完整包装。 7.2.3 独立包装大于500mL的液态产品,应在采样前摇动或用无菌棒搅拌液体,使其达到均匀后采集 适量样品,放入无菌采样容器内作为一个样品。 7.2.4 独立包装大于500g的固态产品,应用无菌采样器从同一包装的不
8、同部分分别采取适量样品,放 入同一个无菌采样容器内作为一件样品。 7.3 采集样品的贮存和运输 7.3.1 应尽快将样品送往实验室检验。 7.3.2 应在运输过程中保持样品完整。 7.3.3 应在接近原有贮存温度条件下贮存样品,或采取必要措施防止样品中微生物数量的变化。 8 操作步骤 8.1 样品制备、增菌培养 称取25 g样品(精确至0.01g),加入装有225 mL改良EC肉汤的500 mL锥形瓶或无菌均质袋内,混 匀后在361恒温培养箱内培养18 h24 h。 8.2 大肠杆菌O157模板DNA的提取 取1 mL8.1得到的增菌液,7000 g离心1 min,弃掉上清液;加入500 mL
9、 ddH2O悬浮沉淀,7000 g离 心1 min,弃掉上清液,重复一次;用100L ddH2O悬浮沉淀后放置于100水浴锅中煮沸10 min,7000 g 离心1 min,取上清液,-20 保存3个月备用。DNA提取也可用等效的商品化DNA提取试剂盒,按照其 说明提取制备大肠杆菌O157基因组DNA。 DB50/T 953-2019 3 8.3 环介导等温扩增 8.3.1 反应体系 在200L的PCR反应管中依次加入10Bst DNA聚合酶缓冲液2.5L、dNTPs 1.5L、MgCl2 1.25 L、引物溶液(外引物、内引物、环引物分别加入0.25L、2L、1L)、模板DNA 2L、Bst
10、 DNA 聚合酶1L、甜菜碱4L、MnCl2 1L、钙黄绿素1L,加入ddH2O补足25L。 8.3.2 反应过程 在63(1)水浴锅或金属浴中放置50 min。 8.4 空白对照、阴性对照、阳性对照设置 试样检测过程应同时设置阴性对照、阳性对照和空白对照。阴性对照为经确证无大肠杆菌O157的 饲料,按8.18.3步骤操作;空白对照设为以水替代DNA模板,按照8.3步骤操作;阳性对照为大肠杆菌 O157标准菌株接种于营养肉汤在361培养18 h24 h后,用无菌生理盐水稀释至约106 CFU/mL至 108 CFU/mL(约麦氏浊度0.4),按8.2提取基因组DNA作为模板,按8.3步骤操作。
11、 8.5 结果观察 反应结束后,将反应管取出观察显色情况(不开盖)。 9 结果判定和表述 9.1.1 在空白对照管和阴性对照管反应液呈橙色,阳性对照管反应液呈绿色的情况下,检测条件成立, 反之本次实验无效。 9.1.2 样品反应管中液体呈橙色,可报告25 g饲料中未检出大肠杆菌O157;样品反应管中液体呈绿 色,说明25 g饲料中大肠杆菌O157初步筛选为阳性,需要对样品增菌液进一步按GB 4789.36中操作 步骤进行确认后报告结果。 DB50/T 953-2019 4 附录A (资料性附录) 大肠杆菌0157靶基因序列 A.1 大肠杆菌O157靶基因序列(accession no AF16332.1) TCTCAATTCT AACTAGGACC GCAGAGGAAA GAGAGGAATT AAGGAATCAC CTTGCAGATA AACTCATCGA AACAAGGCCA GTTTTTTACC CTGTCCACAC GATGCCAATG TACTCGGAAA AATATCAAAA GCACCCTATA GCTGAGGATC TTGGTTGGCG TGGAATTAAT TTACCTAGTT TCCCCAGCCT ATCGAATGAG CAAGTTAT _