1、ICS 65.020 B 04 DB34 安 徽 省 地 方 标 准 DB 34/T 27212016 转基因棉花土壤和水体环境安全检测 技术操作规程 Code of practice for technology of soil and water environmental safety detection of transgenic cotton 文稿版次选择 2016 - 09 - 27发布 2016 - 10 - 27实施 安徽省质量技术监督局 发 布 DB34/T 27212016 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1-2009 给出的规则起草。 本标准由安徽省农业科学院棉花研
2、究所提出。 本标准归口单位:安徽省农业标准化技术委员会。 本标准起草单位:安徽省农业科学院棉花研究所、中国农业科学院棉花研究所、上海市农业科学院 生物技术研究所。 本标准主要起草人:郑曙峰、刘小玲、雒珺瑜、刘华、陈敏、李常凤、王维、徐道青、阚画春、崔 金杰、唐雪明。 DB34/T 27212016 1 转基因棉花土壤和水体环境安全检测技术操作规程 1 范围 本标准规定了转基因棉花土壤养分(有机质、全氮、硝态氮、铵态氮、有效磷、速效钾)、土壤线 虫、土壤酶活性(脲酶、碱性磷酸酶、过氧化氢酶)、土壤微生物多样性及土壤、水体中 Bt 蛋白含量 的术语与定义、取样方法、检测方法等技术要求。 本标准适用
3、于转基因棉花土壤和水体环境安全检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 LY/T 1228 森林土壤氮的测定 LY/T 1234 森林土壤钾的测定 NY/T 88 土壤全磷测定法 NY/T 1121.1 土壤检测 第1部分:土壤样品的采集、处理和贮存 NY/T 1121.6 土壤检测 第6部分:土壤有机质的测定 NY/T 1121.24 土壤检测 第24部分:土壤全氮的测定 自动定氮仪法 NY/T
4、1121.25 土壤检测 第25部分:土壤有效磷的测定 连续流动分析仪法 3 术语和定义 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 贝尔曼浅盘法 Baermann tray method 将 10 目不锈钢筛盘放入配套的浅盘中,在筛盘上放置两层纱网,并加一层线虫滤纸,把土样均匀 铺在滤纸上,加水至浸没土壤,在 20室温条件下经过 48 h 后,收集浅盘中的水,通过 3 个筛网过 筛、冲洗,收集后计数的一种土壤线虫分离方法。 4 检测方法 4.1 原理 4.1.1 采用贝尔曼浅盘法分离土壤线虫,鉴定出线虫的营养性类群,通过引入多样性指数、均匀度指 数等生态学指数进行线虫群落多样性的检测分析。 DB3
5、4/T 27212016 2 4.1.2 采用苯酚-次氯酸钠比色法,根据酶促产物氨与苯酚次氯酸钠作用生成蓝色的靛酚来分析土壤 脲酶活性。 4.1.3 采用磷酸苯二钠比色法,即以磷酸苯二钠为基质,酶解释放出的酚,使其与氯代二溴对苯醌亚 胺试剂反应生色测定出游离的酚量来表示土壤碱性磷酸酶的活性。 4.1.4 采用高锰酸钾滴定法,即用高锰酸钾溶液滴定过氧化氢分解反应,剩余过氧化氢的量来表示土 壤过氧化氢酶活性。 4.1.5 采用PCR-DGGE技术进行微生物多样性分析。 4.1.6 采用酶联免疫法检测转基因棉花土壤、水体中Bt蛋白的含量。 4.2 仪器 4.2.1 电子天平(感量0.01 g)、冰箱
6、、恒温水浴锅、体视显微镜(40)、倒置显微镜(100 和 400)。 4.2.2 研磨机、玻璃研钵、土壤筛:孔径2 mm(10目);1 mm(16目)、分析天平、50 ml三角瓶、 200 ml三角瓶、恒温培养箱、50 mL容量瓶、紫外可见分光光度计、震荡机、 滴定管。 4.2.3 高速冷冻离心机(-1140,离心力大于30,000 g)、PCR扩增仪、电泳仪等。 4.2.4 研钵、冷冻离心机(-1140,离心力大于30,000 g)、酶标仪(波长340-850 nm)、摇 床、低温冰箱、单道微量移液器(2.5 L、10 L、20 L、100 L、200 L、1000 L,连续可调)、 多道微
7、量移液器(8道或12道,10 L、100 L、300 L,连续可调)。 4.3 试剂及配制方法 4.3.1 试剂要求 除非另有说明,仅使用分析纯试剂和符合 GB/T 6682 规定的一级超纯水。 4.3.2 4福尔马林 将 100 mL 40福尔马林溶液加入到 900 mL 的水中,混匀。 4.3.3 甘油-酒精-水混合液 将 100 mL 甘油和 400 mL 酒精加入到 500 mL 的水中,混匀。 4.3.4 10尿素 称取 10 g 尿素,用水溶至 100 mL。 4.3.5 柠檬酸盐缓冲液(PH6.7) 称取 184 g 柠檬酸和 147.5 g 氢氧化钾溶于蒸馏水。将两溶液合并,用
8、 1 mol/L NaOH 将 pH 调 至 6.7,用水稀释至 1000 mL。 4.3.6 苯酚钠溶液(1.35 mol/L) 称取 62.5 克苯酚溶于少量乙醇,加 2 mL 甲醇和 18.5 mL 丙酮,用乙醇稀释至 100 mL(A), 存于冰箱中;27 克 NaOH 溶于 100 mL 水(B)。将 AB 溶液保存在冰箱中。使用前将 2 溶液各 20 mL 混合,用蒸馏水稀释至 100 mL。 4.3.7 次氯酸钠溶液 DB34/T 27212016 3 用水稀释试剂,至活性氯的浓度为 0.9,溶液稳定。 4.3.8 氮的标准溶液 精确称取 0.4717 克硫酸铵溶于水并稀释至 1
9、000 mL,得到 1 mL 含有 0.1 mg 氮的标准液。使用 前将此溶液稀释 10 倍使用。 4.3.9 缓冲液:硼酸盐缓冲液(pH 9.6) 称取 19.05 g 硼砂溶至 1 L,配成 0.05 mol/L 硼砂溶液;称取 8 g NaOH 溶至 1 L,配成 0.2 mol/L NaOH 溶液;取 50 mL 的 0.05 mol/L 硼砂溶液加 23 mL 的 0.2 mol/L NaOH 溶液稀释至 200 mL。 4.3.10 氯代二溴对苯醌亚胺试剂 称取 0.125 g 氯代二溴对苯醌亚胺,用 10 mL 96乙醇溶解,贮于棕色瓶中,存放在冰箱里。保 存的黄色溶液未变褐色之
10、前均可使用。 4.3.11 酚标准溶液 称取 1 g 重蒸酚溶于蒸馏水中,稀释至 1 L,存于棕色瓶中。取 10 mL 酚原液稀释至 1 L,配制 0.01 mg/mL 酚工作液。 4.3.12 0.3过氧化氢溶液 取 1 mL 的 30 H2O2 加 99 mL 蒸馏水。 4.3.13 3 mo1/L硫酸 取 10 mL 硫酸加 50 mL 蒸馏水。 4.3.14 0.1 mo1/L高锰酸钾溶液 称取 1.58 g 的 KMnO4 加 100 mL 蒸馏水。 4.3.15 PCR扩增反应试剂 10Bueffr(Mg 2+ )5.0 L, dNTP(10 mmol/L)5.0 L,上下游引物(
11、10 mol/L)各 1.2 L,模板(土 壤 DNA) 3.0 L,TaqDNA 聚合酶(5 U/L)0.5 L,用无菌 ddH2O 50 L。 4.3.16 Cry1Ab/Cry1Ac平板试剂盒 96 孔板,Cry1Ab/Cry1Ac 标准品,Cry1Ab/Cry1Ac 偶联的酶标抗体,显色剂。 5 操作步骤 5.1 样品采集与处理 5.1.1 土壤样品采集所用方法为正方形五点随机取样法。用土钻采集表层10 cm,直径3 cm的土壤, 再将 5个采样点的土壤混合成一个混合土样,装入自封袋(或无菌袋),作好标签,带回实验室处理。 5.1.2 土壤酶活性测定是用过16目筛的风干土壤样品。 5.
12、1.3 土壤线虫多样性分析是将带回的土样经充分混匀后过4目筛以除去植物根系和残渣等,于4 冰箱保存,并在两周内完成线虫分离。 DB34/T 27212016 4 5.1.4 土壤微生物多样性分析是将无菌自封袋的土壤样品放入 -20保存待用。 5.1.5 水体样品采集是在转基因棉田周围自然水体中,用50 mL离心管取水,密封后放在装有冰袋的 泡沫塑料盒中保存,带回实验室后将水样品进行过滤,去除其中的杂质,4下3000 rpm离心10 min, 将上清液置于 -20保存备用。 5.2 土壤养分的检测 按 LY/T 1228、LY/T 1234、NY/T 88、NY/T 1121.1、NY/T 11
13、21.6、NY/T 1121.24 和 NY/T 1121.25 的规定执行。 5.3 土壤线虫的检测 5.3.1 线虫的分离 将 10 目不锈钢筛放入浅盘中,在筛盘上粘上一层线虫滤纸,称取 50 g 鲜土并均匀地铺在线虫滤 纸上,加水至刚好浸没土样。将浅盘置于 24室温条件下分离 48 h。用 2 个套在一起的 500 目钢筛 过筛,收集浅盘中的线虫悬液,并用自来水冲洗 3 遍。将 2 个钢筛里的线虫都洗到 60 mm 透明的小 塑料培养皿中。分离得到线虫溶液经 60水浴后,保存于 4的福尔马林溶液中。 5.3.2 线虫的计数 线虫计数通过体视显微镜直接观察得到,重复 3 次取平均值,以估算
14、样品中的线虫数量,并折算 成 100 g 干土中线虫的数量。 5.3.3 线虫的鉴定 在每个样品中随机挑取 100 条左右线虫放入甘油、洒精和水的混合溶液中,脱水两周后制片,在 倒置显微镜下鉴定至属,并划分为不同的营养类群:植物寄生线虫、食细菌线虫、食真菌线虫、杂食捕 食性线虫,以及不同的生活 cp 值。 5.3.4 线虫的结果计算与数据分析 5.3.4.1 香农-威纳多样性指数(H) 见公式(1) H=-Pi(lnPi) . (1) 式中: Pi 属 i 的个体总数占总个体数的比例。 5.3.4.2 Pielou均匀度指数(J) 见公式(2) J= H/lnS . (2) 式中: H 实际观
15、察的物种多样性指数, S 为群落中的总物种数。 5.3.4.3 辛普森优势度指数() 见公式(3) DB34/T 27212016 5 =Pi 2 . (3) 式中: Pi 属 i 的个体总数占总个体数的比例。 5.3.4.4 营养多样性指数(TD) 见公式(4) TD=1/Pi 2 . (4) 式中: Pi 为各营养类群在线虫群落中所占的比例。 5.3.4.5 成熟指数(MI) 见公式(5) MI=v(i)f(i) . (5) 式中: v(i) 根据自由生活线虫在生态演替中不同生活策略分别赋予的 c-p 值; f(i) 某一科/属(i)在自由生活线虫(不包括植物寄生线虫)总数中所占比重。 5
16、.3.4.6 富集指数(EI)和结构指数(SI) 见公式(6)(10) EI=100e/(e+b) . (6) SI=100s/(s+b) . (7) b=Ba2+Fu2 . (8) e=Ba1W1+Fu2W2 . (9) s=(BanWn)+(CanWn)+(FunWn)+(OmnWn) . (10) 式中: n=35; W 各类群加权数,W1=3.2,W2=0.8,W3=1.8,W4=3.2,W5=5.0; 各类群字母代表各类群线虫丰度。 5.4 土壤酶活性的检测 5.4.1 土壤酶标准曲线绘制 5.4.1.1 土壤脲酶活性标线绘制 吸取配置好的氮溶液 10 mL,定容至 100 mL,即
17、稀释了 10 倍,吸取 0,1,3,5,7,9,11,13 mL 移至 50 mL 容量瓶,加水至 20 mL,再加入 4 mL 苯酚钠,仔细混合,加入 3 mL 次氯酸钠,充分 摇荡,放置 20 min,用水稀释至刻度。将着色液在紫外分光光度计上于 578 nm 处进行比色测定,以 标准溶液浓度为横坐标,以光密度值为纵坐标绘制曲线图。 5.4.1.2 土壤碱性磷酸酶活性标线绘制 DB34/T 27212016 6 取 0、1、3、5、7、9、11、13 mL 酚工作液,置于 50 mL 容量瓶中,每瓶加入 5 mL 硼酸缓冲液 和 4 滴氯代二溴对苯醌亚胺试剂,显色后稀释至刻度,30 min
18、 后,在紫外可见分光光度计上 660 nm 处 比色。以显色液中酚浓度为横坐标,吸光值为纵坐标,绘制标准曲线。 5.4.2 高锰酸钾的标定 准确称取约 0.2 g 在 110干燥至恒量的基准草酸钠。加入 250 mL 新煮沸过的冷水、10 mL 硫 酸,搅拌使之溶解。将草酸钠溶液加热到 7585 (即开始冒蒸气时的温度),趁热用待标 KMnO4 溶 液进行滴定。开始滴定时反应速度很慢,待溶液中产生 Mn 2+ 后,反应速度加快,但滴定时仍必须是逐 滴加入,至溶液呈粉红色,半分钟内不褪色即为终点。注意滴定结束时的温度不应低于 60。 5.4.3 土壤酶活性测定 5.4.3.1 土壤脲酶活性测定
19、取 5 g 过 16 目筛的风干土样,置于 50 mL 三角瓶中,加 1 mL 甲苯。于 15 min 后,先加入 10 尿素 10 mL 后,再加入 pH 6.7 柠檬酸盐缓冲液 20 mL。摇充分后 37恒温培养 24 h。取出后用中 速定量滤纸过滤,将吸 3 mL 滤液置于 50 mL 容量瓶中,然后每瓶中加入 17 mL 蒸馏水。再吸苯酚钠 溶液 4 mL 和次氯酸钠溶液 3 mL 边加边摇匀。于室温静置 20 min 显色后,定容至 50 mL。溶液呈现 (青定)酚的蓝色。1 h 内在紫外可见分光光度计上于 578 nm 波长处进行比色。无土对照:不加土样, 其他操作与样品实验相同。
20、以检验试剂纯度,整个实验设置一个对照。无基质对照:以等体积的水代替 基质,其他操作与样品实验相同。每个土样都设此对照。 5.4.3.2 土壤碱性磷酸酶活性测定 取 5 g 过 16 目筛的风干土样,置于 200 mL 三角瓶里,加 2.5 mL 甲苯,轻摇 15 min 后,加 入 20 mL 0.5磷酸苯二钠,仔细摇匀后放入恒温箱,37下培养 24 h。取出后在培养液加入 100 mL 0.3硫酸铝溶液并过滤。吸取 3 mL 滤液于 50 mL 容量瓶中,然后加入 5 mL 硼酸缓冲液和4滴氯代 二溴对苯醌亚胺试剂,显色后稀释至刻度,30 min 后,在紫外可见分光光度计上 660 nm 处
21、比色。无 土对照:不加土样,其他操作与样品实验相同。以检验试剂纯度,整个实验设置一个对照。无基质对照: 以等体积的水代替基质,其他操作与样品实验相同。每个土样都设此对照。 5.4.3.3 土壤过氧化氢酶活性测定 取 2 g 风干土置于 100 mL 的三角瓶中,加入蒸馏水 40 mL 和 0.3过氧化氢溶液 5 mL,120 rpm 转速振荡 20 min。震荡结束后取出来加入 3 mo1/L 的 H2S04 5 mL,过滤要慢速度,将滤液 25 mL 移 至广口三角饼中,用 0.1 mol/L 的高锰酸钾滴定至颜色为淡粉红色。无土对照:不加土样,其他操作 与样品实验相同。以检验试剂纯度,整个
22、实验设置一个对照。无基质对照:以等体积的水代替基质,其 他操作与样品实验相同。每个土样都设此对照。 5.4.4 土壤酶活性计算 5.4.4.1 土壤脲酶活性计算 土壤脲酶活性以 24 h 后 100 g 土壤中 NH3N 的毫克数表示。 见公式(11) M(X样品X无土X无基质)10010 . (11) 式中: M 土壤脲酶活性值; DB34/T 27212016 7 X 样品 样品实验的光密度值在标准曲线上对应的 NH3N 毫克数; X 无土 无土对照实验中的光密度值在标准曲线上对应的 NH3N 毫克数; X 无基质 无基质对照实验中的光密度值在标准曲线上对应的 NH3N 毫克数; 100
23、样品定容的体积与测定时吸取量的比值; 10 酶活性单位的土重与样品土重之比值。 5.4.4.2 土壤碱性磷酸酶活性计算 以 24 h 后 1 g 土壤中释放出的酚的质量(mg)表示磷酸酶活性。 见公式(12) M=(X样品X无土X无基质)Vnm . (12) 式中: M 土壤碱性磷酸酶活性值; X 样品 样品实验的光密度值在标准曲线上对应的酚毫克数; X 无土 无土对照实验中的光密度值在标准曲线上对应的酚毫克数; X 无基质 无基质对照实验中的光密度值在标准曲线上对应的的酚毫克数; V 显色液体积; n 分取倍数,浸出液体积吸取滤液体积; m 烘干土重。 5.4.4.3 土壤过氧化氢酶活性计算
24、 土壤过氧化氢酶活性以 1 g 土壤所消耗的高锰酸钾的毫克数来表示。 见公式(13) MXaXbXc . (13) 式中: M 土壤过氧化氢酶活性值; Xa 样品实验 25 mL 滤液所消耗的高锰酸钾量(毫升数); Xb 无土对照实验中 25 mL 滤液所消耗的高锰酸钾量(毫升数); Xc 无基质对照实验中 25 mL 滤液所消耗的高锰酸钾量(毫升数)。 5.5 土壤微生物多样性的检测 5.5.1 微生物总DNA的提取 称取 0.5 g 玻璃珠加入到 0.5 g 土壤样品中,然后加入 1 mL SLX-MLus 缓冲液,漩涡震荡 5 min, 再加入 100 L DS 缓冲液,混匀,70水浴
25、10 min,上下颠倒混匀。3000 rpm 室温离心 3 min,取 800 L 上清液至 2 mL 离心管中,再加入 270 L P2 缓冲液,混匀。冰浴 5 min,4,13000 g 离心 5 min,转移上清液至 2 mL 离心管中,加入 0.7 倍体积异丙醇,颤倒 30 次,混匀。4,13000 g 离 心 10 min,弃上清,倒置于滤纸上控干。加 200 L 洗脱缓冲液,涡旋 10 s 混匀;70水浴 20 min, 再加入 100 L HTR 试剂,混匀,室温放置 2 min;13000 g 离心 2 min,吸取上清液转至新的 2 mL 离 心管中,加入等体积 XP2 缓冲
26、液,混匀。将吸附柱套入收集管,样品倒入吸附柱中,10000 g 离心 1 min, 弃废液,重新套入收集管,加入 700 L SPW,10000 g 离心 1 min,弃废液,重新套入收集管,重复 上述操作 1 次。套入收集管,13000 g 条件下,空管离心 2 min,取吸附柱套入 1.5 mL 离心管中, 加入 50 L 洗脱缓冲液,70水浴 15 min,13000 g 离心 1 min,重复上述操作 1 次,终体积为 100 DB34/T 27212016 8 L。所有的 DNA 样品用 1琼脂糖凝胶电泳进行检测,于 -20保存。所得微生物基因组大小均为 1.5 Kb 左右,条带较为
27、清晰。经吸光度检测后需满足后续 PCR 的要求。 5.5.2 基因组DNA的PCR扩增 以 4.4.6 的 DNA 为模板,NS7-GC、NS8 为引物对基因组 DNA 进行了特异扩增,得到了大小为 340 bp 左右的清晰条带。94预变性3 min,94变性 45 s,50退火 45 s,72延伸 45 s,进行 35 个 循环,72延伸 10 min。PCR 完成后,取 5 L 用 1琼脂糖凝胶电泳进行检测。 5.5.3 DGGE电泳 使用 Bio-rad 的 DcodeTM 系统对 PCR 产物进行变性梯度凝胶电泳(DGGE),制备浓度为 8的 聚丙烯酰胺凝胶,变性梯度为 35-65(1
28、00的变性剂为 6.4 M 的尿素和 40的去离子甲酰胺), 电泳缓冲液为 1TAE(40 mmol/L 乙酸,1 mmol/L EDTA, 40 mmol/L Tris, pH 7.2),上样量为 15 l PCR 产物+4 l 6酚蓝二甲苯氰溶液。电泳条件为:温度 60,电压 80 V,时间 12 h.电泳完毕后, 用 SYB Green I(1TAE,1:10000 稀释)染色 60 min,然后用 Bio-rad 凝胶成像系统进行拍照并对 结果进行分析。 5.5.4 微生物多样性指示指标计算 5.5.4.1 丰度 丰度是指某个样品中所有条带的总和,可以在一定程度上反映群里中优势菌群的多
29、样性。 5.5.4.2 优势度 优势度是指样品中某个条带峰面积占此样品总体峰面积的比例,它反映的是某个菌种菌体数量的多 少。通过比较优势度,可以直观的了解到样品中优势菌群的变化情况。 5.5.4.3 Shannon-Weiner指数 Shannon-Weiner 指数表示的是样品中菌群的种类以及菌体数量分配均匀度的情况,即菌群种类越 多或者菌体数量在各条带中分配越均匀,其值越大,微生物多样性越高。 5.5.4.4 相似度指数 相似度指数(戴斯系数 Cs)主要反映的是各样品的条带图谱的相似性关系,其数值的大小代表了 两个样品中菌群结构相似性程度。数值越大,表明相似度越高。 5.5.4.5 辛普森
30、多样性指数 辛普森多样性指数用于判断群落物种多样性,其值越高,说明物种多样性越高。 5.6 Bt蛋白测定 5.6.1 超滤浓缩 吸取 15 mL 处理后的水体上清液于 Amicon Ultra-15 超滤离心管中,4000 rpm 离心 30 min。离 心结束后,每个超滤管内加入 2.0 mL PBS 提取液轻轻冲洗滤膜,继续离心 20 min,上清液即为浓缩 了的含有 Bt 蛋白的溶液。 5.6.2 检测步骤 DB34/T 27212016 9 取离心后的上清液 50 L 加入到已包埋好抗体的 96 孔板中,180 r/min 振荡培养 1.5 h,分别 加入空白对照和阳性对照各 50 L
31、;震荡 2030 s,混匀,于 200 r/min 振荡室温保湿孵育 12 h; 将孔中液体倒入废液池中,注满洗涤缓冲液,重复洗涤三次,最后尽量将洗涤液倒干净;加入 100 L 基 质液,震荡 2030 s,混匀,于 200 r/min 振荡室温保湿孵育 1530 min;加入 100 L 终止液, 充分混匀,30 min 内在波长 450 nm 处读取吸光值。 5.6.3 Bt蛋白含量计算 将阳性质控物按照一定梯度进行稀释,以阳性质控物中 Bt 蛋白浓度为横坐标,扣除空白对照 OD450 吸光值为纵坐标,进行回归分析,建立标准曲线,获得标准曲线方程。 测定样品 OD450 吸光值,扣除空白对照后带入上述所得方程,即得到样品中 Bt 蛋白含量。 _