1、ICS 11.220 B 41 DB33 浙江省 地方标准 DB33/T 2268 2020 猫细小病毒 PCR检测方法 PCR detection technique for feline panleukopenia virus 2020 - 06 - 30发布 2020 - 07 - 30实施 浙江省市场监督管理局 发布 DB33/T 2268 2020 I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1 2009的规定编写。 本标准由 浙江省农业农村厅 提出。 本标准由浙江省畜牧兽医和饲料标准化技术委员会归口。 本标准起草单位:浙江省动物疫病预防控制中心 。 本标准 主要 起草人: 张红丽、徐 辉
2、、赵灵燕、周彩琴、 吴贇竑 、黄 靖、 吕见涛、 刘爱军、刘 霞、 吴雪军、孙冰冰 、章杭建。 DB33/T 2268 2020 1 猫细小病毒 PCR检测方法 1 范围 本标准规定了 猫细小病毒 PCR( polymerase chain reaction) 的实验条件、操作步骤、结果判定 。 本标准适用于 猫细小病毒(猫泛白细胞减少症病毒) 的检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅 注日期的版本 适用于本文件。 凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 3 术语
3、和定义 下列术语和定义适用于本 文件 。 3.1 猫细小病毒 Feline panleukopenia virus, FPLV 属细小病毒科,细小病毒亚科,牛犬细小病毒属成员,又称猫泛白细胞减少症病毒、猫传染性胃肠 炎病毒或猫瘟病毒。 4 实验条件 4.1 试剂 4.1.1 要求 除另有规定外,所用试剂 为分析纯 或生化试剂 ,水为符合 GB/T 6682要求 的灭菌双蒸水或超纯水。 4.1.2 试剂 4.1.2.1 核糖核酸酶( 20 mg/mL) 。 4.1.2.2 10%十二烷基磺酸钠溶液 。 4.1.2.3 10 mg/mL 蛋白酶 K。 4.1.2.4 Tris-盐酸 饱和酚( pH
4、 7.6)。 4.1.2.5 酚 -氯仿 -异戊醇混合液 ( 25: 24: 1) : 在一灭菌棕色瓶中按 25: 24: 1比例分别加入 酚、 氯 仿、异戊醇 。 4.1.2.6 3 mol/L 乙酸钠( pH 5.4) 。 4.1.2.7 琼脂糖。 DB33/T 2268 2020 2 4.1.2.8 10 g/L 溴化乙锭 ( ethidium bromide, EB): 溴化乙锭 20 mg、加灭菌双蒸水至 20 mL 充 分溶解混匀而成。 4.1.2.9 50TAE 缓冲液 : 羟基甲基氨基甲烷 ( Tris) 242 g、冰乙酸 57.1 mL、 0.5 mol/L 乙二铵四乙 酸
5、 二钠溶液 ( pH 8.0) 100 mL,加灭菌双蒸水至 1 000 mL 充分混匀。 4.1.2.10 加样缓冲液: 聚蔗糖 25 g、溴酚蓝 0.1 g、二甲苯青 0.1 g,加灭菌双蒸水至 100 mL充分溶 解混匀而成。 4.1.2.11 2.5 mmol dNTPs( deoxyribonucleoside triphosphates, 脱氧核糖核苷三磷酸 )。 4.1.2.12 10PCR Buffer。 4.1.2.13 DNA 分子量标准: DL2000。 4.1.2.14 引物 序列 FPLV-F: 5 CCAGCTGAGGTTGGTTATAGTG 3; FPLV-R:
6、5 GGTGCATTTACATGAAGTCTT GG 3。 4.2 仪器设备 4.2.1 高速冷冻离心机:要求最大离心力在 12 000rpm 以上。 4.2.2 PCR 扩增仪。 4.2.3 核酸电泳仪和水平电泳槽。 4.2.4 微波炉。 4.2.5 分析天平。 4.2.6 恒温水浴锅。 4.2.7 冷藏 冰箱和 低温冷冻 冰箱。 4.2.8 微量移液器。 4.2.9 凝胶成像系统(或紫外透射仪)。 4.2.10 高压灭菌锅。 4.2.11 超净工作台或生物安全柜 。 5 操作步骤 5.1 样品的采集和处理 5.1.1 采集动物 粪便 、肛拭子、全血或肠道等组织样品并进行处理 : a) 肛拭
7、子、粪便(加适量 PBS)等样品经 4 5 000 rpm/min离心 2 min,取上清液; b) 全血样品待血凝后经 5 000 rpm/min 离心 2 min,取血清; c) 取 0.1 g 肠道等样品 与灭菌 PBS(全称、浓度) 按 1: 5 的重量体积比制成悬液, 匀浆后,反复 冻融 3次, 在涡旋混合器上混匀后 经 4 5 000 rpm/min离心 10 min, 取上清液。 5.1.2 制备的样品在 2 8 保存 时间 不应超过 24 h,长期保存应分装成小管,置于 -20 以下 ,避 免反复冻融。 5.2 DNA的提取 5.2.1 设立阳性、阴性样品对照,阳性对照为 猫细
8、小病毒 阳性样品,阴性对照为 灭菌双蒸 水。 5.2.2 按下列步骤完成 DNA的提取 ,也可 选择市售商品化 DNA 提取试剂盒,完成 DNA 的提取 : a) 取 1.5 mL灭菌离心管,加入处理样品 5.1.1 上清液 400 L和 30 L( 20 mg/mL)核糖核酸酶, 混匀后,室温下作用 20 min; DB33/T 2268 2020 3 b) 加入 43 L 10%的十二烷基磺酸钠溶液和 5 L 蛋白酶 K, 42 水浴温育过夜(或 55 30 min 以上) ; c) 加入等量的 Tris-盐酸饱和酚,充分混匀, 12 000 rpm/min 离心 5 min,小心吸出上层
9、水相于 新的 1.5 mL 灭菌离心管中 ; d) 加等量的酚 -氯仿 -异戊醇( 25: 24: 1),充分混匀, 12 000 rpm/min 离心 5 min,小心吸出上 层水相至新的 1.5 mL 灭菌离心管中 ; e) 加 1/10 体积 3 mol/L 的乙酸钠( pH 5.4), 2.5 倍体积预冷的无水乙醇 15 000 rpm/min 离心 20 min,弃去乙醇, 75%的乙醇洗涤沉淀一次后真空干燥 。 用 20 L 灭菌双蒸水溶解沉淀, -20 保存备用。 5.3 PCR反应 5.3.1 反应体系组成 设立阳性对照和阴性对照。按表 1 所述 反应体系组成 ,严格在冰盒上配
10、置 25 L PCR扩增体系。 表 1 每个样品反应体系配制表 试剂 用量( L) 10 PCR buffer 2.5 dNTPs( 2.5 mM) 2 FPLV-F/FPLV-R( 20 uM) 各 0.5 TaqDNA 聚合酶 ( Taq DNA Polymerase) 0.2 DNA 模板 1 灭菌 双 蒸 /超纯水 18.3 总量 25 5.3.2 反应条件 94 3 min; 94 45 s, 55 30 s, 72 30 s,循环 35 次, 72 延伸 10 min 结束。 5.4 电泳 5.4.1 1%琼脂糖凝胶的制备 用琼脂糖 1.0 g, 0.5TAE 电泳缓冲液 100
11、mL,混匀后在微波炉中完全融化,待冷至 50 60 时, 加溴化乙锭( EB)溶液 5 L,摇匀倒入电泳 板上,凝固后取下梳子,备用。 5.4.2 加样 取 5 L PCR产物与 0.5 L 10 加样缓冲液混合,加入琼脂糖凝胶板的加样孔中。 每次电泳加阳性 对照和阴性对照的扩增产物,并设立 DNA分子量标准 ( DL2000)做分子质量大小对照 。 5.4.3 电泳 DB33/T 2268 2020 4 盖好电泳仪,插好电极, 5 V/cm电压电泳, 30 min 45 min(指示试剂跑至 1/3 处) 。 5.4.4 结果观察 用紫外凝胶成像仪或者紫外透射仪观察扩增结果。 6 结果判定 在阳性对照出现 464 bp的 扩增带、阴性对照无 目的 条带 的 条件下, 待检样品出现 464 bp 的扩增条 带,则 判定为 样品阳性, 否则判定为阴性。 _