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    DB21 T 3256—2020 非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法.pdf

    • 资源ID:1480024       资源大小:459.56KB        全文页数:7页
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    DB21 T 3256—2020 非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法.pdf

    1、ICS 11.220 B 41 DB21 辽宁省 地 方 标 准 DB21/T 3256 2020 非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法 Loop-mediated Isothermal Amplification( LAMP) for Rapid Detection for African Swine Fever Virus 2020 - 04 - 30 发布 2020 - 05 - 30 实施 辽宁省市场监督管理局 发布 DB21/ XXXXX XXXX I 前 言 本标准按照 GB/T 1.1 2009 给出的规则起草。 本标准由辽宁省农业农村厅提出并归口管理。 本标准起草单位:辽宁省农业发

    2、展服务中心、中国科学院微生物研究所、洛阳莱普生信息科技有限 公司、辽宁佰瑞生物科技有限公司。 本标准主要起草人:杨作丰 、周晨阳、李秀梅、王宏燕、杨利敏、董娜、刘文军、张皓淳、姚伟、 刘洋、刘近、吴洪涛、任雪建、赵培、李蓉、章春燕、吕园园、 陈腾 。 本标准发布实施后,任何单位和个人如有问题和意见建议,均可以通过来电和来函等方式进行反馈, 我们将及时答复并认真处理,根据实际情况依法进行评估 及复审。 归口管理部门通讯地址:辽宁省农业农村厅(沈阳市和平区太原北街 2号),联系电话: 024-23447862; 标准起草单位通讯地址:辽宁省动物及产品检疫中心(沈阳市沈河区万柳塘路 105号甲),联

    3、系电 话: 024-24229579。 DB21/T 3256 2020 1 非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法 1 范围 本标准规定了非洲猪瘟病毒等温扩增快速检测方法的技术要求。 本标准适用于非洲猪瘟疫病的诊断、监测及流行病学调 查,适用于猪血液、脾脏、淋巴结、肾脏等 组织样品中非洲猪瘟病毒核酸的快速检测。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的 。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文 件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB 19489 实验室 生物安全通用要求 3 原理 非洲猪瘟病毒是一种 DNA病毒,该检测方法利用 6条

    4、特异性引物和具有链置换能力的 DNA聚合酶,在 等温环境下 1 h内完成扩增,用于非洲猪瘟病毒的核酸检测。 4 仪器和器材 4.1 高速台式冷冻离心机(离心范围 0 20000 r/min) 4.2 冰箱: 4 1 冰箱, -20 1 冰箱, -7 1 冰箱 4.3 恒温 LAMP 扩增仪(型 号: Gene-8C) 4.4 离心管: 15 ml 离心管、 1.5 ml 离心管和 0.2 ml PCR 专用离心管 4.5 微量移液器: 1000 l, 200 l, 100 l, 50 l, 20 l, 10 l, 2 l 5 试剂和引物 5.1 样品处理剂 5.2 ASFV-R-Mix 5.3

    5、 Bst enzyme 5.4 D-I 矿物油 5.5 阳性对照 5.6 阴性对照 注:本技术规范中使用的试剂,除另有说明外,所有实验使用的试剂等级均为不含 DNA或 DNase的分析纯或生化试剂; 所有试剂均用无菌的容器分装。 DB21/T 3256 2020 2 6 操作 步骤 6.1 样品的采集、前处理、存放与运输 6.1.1 采样注意事项 采集样品及样品前处理过程中应戴一次性手套,样本间不得交叉污染。 6.1.2 采样工具 15 ml离心管和 1.5 ml离心管经 121 1 高压灭菌 20 min;剪刀、镊子经 160 干热灭菌 2 h,无 菌管(真空采血管)。 6.1.3 组织病料

    6、的采集与前处理 采集疑似非洲猪瘟病毒感染猪的肺脏、肝脏、肾脏、脾脏等组织样品,用无菌的剪刀和镊子剪取待 检样品约 10 g于组织匀浆器或研钵中充分匀浆或研磨,加入 0.3 ml 0.5 ml组织悬液混匀, 60 , 30 min 灭活后,将悬液转入无菌 Eppendorf管中, 4 条件下 5000 r/min离心 10 min,编号备用。 6.1.4 全血及血清样本的采集与前处理 使用含有抗凝血剂( EDTA-紫色盖)的无菌管(真空采血管)从耳静脉或前腔静脉采集血液 3 ml 5 ml, 60 , 30 min灭活后,可直接检测; 若检测血清,可静置全血样本待血清析出后,直接吸取至无 菌 E

    7、ppendorf管中, 60 , 30 min灭活后,编号备用。 6.1.5 存放与运输 采集或处理的样品在 2 8 条件下保存应不超过 24 h; 若需长期保存,应放置 -70 冰箱,但应 避免反复冻融(冻融不超过 3次)。采集的样品密封后,采用保温壶或保温桶加冰密封,在 8 h之内运送 到实验室检测。按照兽医实验室生物安全技术管理规范进行样品的生物安全标识。 6.2 样品 DNA 的提取 取 10 l前处理过的样本加入无菌 1.5 ml离心管,加入 10 l样品处理剂,混匀, 94 裂解 2 min, 瞬时离心,上清即为扩增模板。 6.3 核酸扩增 6.3.1 吸取 22 l ASFV-R

    8、-Mix 和 1 l Bst enzyme 加入同一个 PCR 管,吸取 2 l 步骤 6.2 处理的 核酸扩增模板加至 PCR 管,混匀,设置阴阳性对照; 6.3.2 吸取 10 l D-I 矿物油轻轻加至 PCR 管液面,切勿震荡混匀; 6.3.3 插入到恒温扩增仪反应槽中; 6.3.4 设置恒温扩增仪器反应条件为: 65 反应 12 min,荧光采集周期 20 s。 7 试验成立条件与结果判定 7.1 试验成立条件 使用前用阴、阳性对照进行该检测方法评价,若阳性对照 CT值 40,阴性对照 CT值 40,则检测结 果有效。 DB21/T 3256 2020 3 7.2 结果判定 若 CT

    9、值 40,样品应判定为非洲猪瘟病毒核酸阳性;若 CT值 40,样品应判定为非洲猪瘟病毒核酸 阴性 8 实验室生物安全要求 按照 GB19489 实验室生物安全 通用要求执行。 DB21/T 3256 2020 4 A A 附 录 A (规范性附录) 试剂配制 A.1 样品处理剂的制备 量取 80 ml PBS( 0.01 mol/L, pH值 7.4),加入 10 l NP40(乙基苯基聚乙二醇),无菌纯化水 定容至 100 ml,定量分装, 500 l/管, -20 保存。 A.2 ASFV-R-Mix的制备 A.2.1 引物合成 根据非洲猪瘟病毒 p72基因片段的保守结构域设计 3对引物,

    10、包括 1对内引物( FIP与 BIP)、 1对外引 物( F3与 B3)和 1对环引物( LF与 LB),均由上海生工生物工程股份有限 公司合成,序列为: FIP: 5-TAACGCCACTATGCAGCCCACGGAAGAGCTGAATCTCTATCCT-3 BIP: 5-CAACATGTGCGAACTTGTGCCACATACCTGGAACGTCTCC-3 F3: 5-ATAGGTAATGCGATCGGATACA-3 B3: 5-CCAACAATAACCGCCACGC-3 LF: 5-TCGCCACGCAAAGATAAGC-3 LB: 5-AGCCTCGGTGTTGATGCGGATT-3 A

    11、.2.2 引物混合物的 制备 取 3对引物( FIP、 BIP、 F3、 B3、 LF和 LB)干粉,按引物说明书分别加入适量无菌纯化水,溶解混 匀,得到各引物溶液,置 -20 保存。 A.2.3 ASFV-R-Mix的配制 称取 2.4 g Tris, 0.37 g氯化钾, 0.12 g硫酸镁, 100 l吐温 -20, 7.029 g甜菜碱,溶于 80 ml 纯化水,依次加入终浓度为 1.4 mmol/L dNTPs溶液、 0.2 mol/L外引物溶液、 1.6 mol/L内引物溶液、 0.8 mol/L环引物溶液,加入无菌纯化水定容至 100 ml,经过 0.22 m滤器过滤除菌,分装至

    12、 2 ml蓝 盖可立冻存管中, 1.1 ml/管, -20 保存。 A.3 Bst enzyme的制备 用于制备本试剂盒的 Bst enzyme为商品化 DNA聚合酶,按使用说明书用纯化水稀释至 4 106/L,分 装至 0. 5ml白盖可立冻存管中, 100/ l管, -20 保存。 A.4 D-I矿物油 用于制备本试剂盒的 D-I矿物油为商品化矿物油,分装至 2 ml黄盖可立冻存管中, 500 l/管, -20 保存。 A.5 阳性对照 采用核酸蛋白质分析仪测定阳性 质控品浓度,计算质粒拷贝数,用纯化水将其稀释为 103拷贝 / l, 分装至 0.5 ml红盖可立冻存管中, 100 l/管, -20 保存。 A.6 阴性对照 取纯化水,分装至 0.5 ml绿盖可立冻存管中, 100 l/管, -20 保存。 DB21/T 3256 2020 5 _


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